187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2451 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  43.9 
 
 		 1096 aa  772    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 1219 aa  2397    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  72.04 
 
 		 696 aa  738    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  40.45 
 
 		 827 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  54.63 
 
 		 1047 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  40.2 
 
 		 675 aa  353  8e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  53.07 
 
 		 482 aa  289  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  38.77 
 
 		 499 aa  277  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  37.47 
 
 		 694 aa  269  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  39.07 
 
 		 1141 aa  234  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  35.71 
 
 		 1152 aa  191  9e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  31.78 
 
 		 1285 aa  170  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.46 
 
 		 587 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  31.57 
 
 		 1406 aa  155  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  31.81 
 
 		 14944 aa  153  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.91 
 
 		 12684 aa  153  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.16 
 
 		 587 aa  148  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  44.62 
 
 		 606 aa  147  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  43.17 
 
 		 606 aa  141  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.21 
 
 		 612 aa  126  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1457 aa  125  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  32.06 
 
 		 846 aa  125  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  29.44 
 
 		 3586 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  42.71 
 
 		 343 aa  119  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  27.13 
 
 		 744 aa  119  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.66 
 
 		 626 aa  119  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.64 
 
 		 626 aa  115  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  30 
 
 		 3562 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  30.3 
 
 		 4761 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  29 
 
 		 846 aa  108  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  27.24 
 
 		 1332 aa  108  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  27.04 
 
 		 5743 aa  107  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.82 
 
 		 6885 aa  107  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.04 
 
 		 1143 aa  105  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  30.31 
 
 		 1146 aa  105  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  28.42 
 
 		 3516 aa  104  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  26.7 
 
 		 846 aa  103  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1452 aa  103  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  29.07 
 
 		 848 aa  103  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  43.16 
 
 		 1054 aa  100  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  30.12 
 
 		 4106 aa  99  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2709  BNR domain-containing protein  23.35 
 
 		 1554 aa  98.2  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  42.02 
 
 		 1053 aa  96.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  33.82 
 
 		 1127 aa  96.3  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  28.7 
 
 		 491 aa  95.9  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  33.82 
 
 		 1127 aa  95.5  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  30.45 
 
 		 895 aa  91.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.45 
 
 		 2927 aa  91.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  23.04 
 
 		 14609 aa  90.9  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  32.08 
 
 		 1127 aa  90.9  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  38.5 
 
 		 1051 aa  90.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  33.09 
 
 		 1127 aa  89  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  29.39 
 
 		 1129 aa  87  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  32.28 
 
 		 1059 aa  85.9  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  34.04 
 
 		 1362 aa  85.9  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  24.07 
 
 		 1695 aa  84.7  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  27.36 
 
 		 3325 aa  84.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  25.45 
 
 		 5561 aa  83.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  25.04 
 
 		 5559 aa  82.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  25.41 
 
 		 5561 aa  82.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  28.81 
 
 		 4689 aa  81.6  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  24.71 
 
 		 5559 aa  80.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 		 1224 aa  79  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  24.35 
 
 		 2552 aa  77.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  24.67 
 
 		 5561 aa  78.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  25.46 
 
 		 4480 aa  76.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  50.54 
 
 		 1031 aa  74.3  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.96 
 
 		 5216 aa  74.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  30.32 
 
 		 916 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  39.1 
 
 		 1123 aa  73.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1090  hypothetical protein  35.15 
 
 		 771 aa  73.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  26.96 
 
 		 2704 aa  72  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  24.61 
 
 		 1951 aa  71.6  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  30.1 
 
 		 3824 aa  71.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  28.64 
 
 		 2911 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  28.93 
 
 		 3204 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  30.64 
 
 		 3824 aa  70.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  27.3 
 
 		 1424 aa  70.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  29.3 
 
 		 3824 aa  68.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  30.31 
 
 		 3721 aa  68.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  29.59 
 
 		 3739 aa  68.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  30.62 
 
 		 2456 aa  68.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  29.41 
 
 		 1601 aa  66.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  33.86 
 
 		 1439 aa  66.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  36.23 
 
 		 1496 aa  65.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  30.13 
 
 		 2886 aa  65.5  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  23.66 
 
 		 2528 aa  65.1  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  28.91 
 
 		 2625 aa  65.1  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  25.77 
 
 		 962 aa  65.1  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  38.61 
 
 		 663 aa  63.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.25 
 
 		 3552 aa  63.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  50.67 
 
 		 767 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  26.52 
 
 		 831 aa  63.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  22.01 
 
 		 1224 aa  62.4  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  26.84 
 
 		 1428 aa  62.4  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  28.97 
 
 		 3925 aa  62  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  26.21 
 
 		 1887 aa  61.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  24.96 
 
 		 3736 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  30.49 
 
 		 777 aa  60.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  26.95 
 
 		 1529 aa  60.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>