More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2416 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  100 
 
 		 443 aa  915    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  37.74 
 
 		 437 aa  275  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  36.6 
 
 		 439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  38.91 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  35.04 
 
 		 433 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  34.19 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  32.36 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  34.6 
 
 		 439 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  31.6 
 
 		 453 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  33.05 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  31.66 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  28.09 
 
 		 406 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  26.17 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  27.54 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  25.7 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  28.84 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  28.91 
 
 		 413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  26.87 
 
 		 410 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  26.71 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  26.11 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  27.82 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  27.17 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  27.54 
 
 		 413 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  26.56 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  27.52 
 
 		 395 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  25.97 
 
 		 410 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  25.99 
 
 		 413 aa  109  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  26.53 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  27.42 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  26.97 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  27.51 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  26.68 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  28.04 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  28.01 
 
 		 395 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  27.13 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  26.07 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  29.34 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  25.33 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  27.55 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  27.55 
 
 		 409 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  26.51 
 
 		 446 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  26.94 
 
 		 397 aa  103  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  27.8 
 
 		 400 aa  103  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  24.11 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  26.35 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  26.86 
 
 		 455 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  25.06 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  27.15 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  26.47 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  25.47 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  24.07 
 
 		 422 aa  99.8  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  25.5 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  29.4 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  25.18 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  25.47 
 
 		 404 aa  99  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1878  putative integrase  26.49 
 
 		 425 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  26.59 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  25.18 
 
 		 438 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  26.87 
 
 		 402 aa  97.4  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  28.1 
 
 		 434 aa  97.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  29.33 
 
 		 361 aa  97.1  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  25.06 
 
 		 421 aa  97.1  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  24.48 
 
 		 421 aa  96.3  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  27.08 
 
 		 403 aa  96.3  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  24.07 
 
 		 402 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  24.71 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  25.29 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  25.42 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  25.63 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  26.19 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  25.28 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  24.42 
 
 		 420 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  27.63 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  25.76 
 
 		 440 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  27.06 
 
 		 396 aa  94  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  26.42 
 
 		 411 aa  94  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  25.71 
 
 		 404 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 404 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  24.95 
 
 		 426 aa  93.2  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  24.4 
 
 		 409 aa  93.2  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  27.46 
 
 		 420 aa  93.2  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  26.56 
 
 		 394 aa  92.8  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  27.15 
 
 		 418 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  27.7 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  24.76 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  23.23 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  26.06 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  25.28 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  24.7 
 
 		 389 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  26.68 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  24.6 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  24.53 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2383  integrase family protein  27.36 
 
 		 427 aa  90.5  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  26.75 
 
 		 393 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  24.53 
 
 		 410 aa  90.5  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  26.39 
 
 		 402 aa  90.1  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  24.83 
 
 		 415 aa  90.1  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  25.97 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>