More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2351 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  100 
 
 		 325 aa  655    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  56.95 
 
 		 327 aa  355  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  57 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.17 
 
 		 321 aa  352  5e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  56.29 
 
 		 327 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  57.74 
 
 		 327 aa  350  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.86 
 
 		 322 aa  349  4e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  56.77 
 
 		 334 aa  348  8e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  55.31 
 
 		 327 aa  348  8e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  57.33 
 
 		 328 aa  347  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  56.19 
 
 		 328 aa  347  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  58.48 
 
 		 305 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  56.91 
 
 		 334 aa  345  6e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  55.88 
 
 		 328 aa  345  7e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  55.3 
 
 		 342 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  55.34 
 
 		 329 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  55.3 
 
 		 343 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  55.92 
 
 		 334 aa  341  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  53.97 
 
 		 326 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  54.78 
 
 		 326 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  55.63 
 
 		 326 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  56.76 
 
 		 322 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  55.63 
 
 		 327 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  54.69 
 
 		 332 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  57.64 
 
 		 322 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  57.09 
 
 		 327 aa  337  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  54.26 
 
 		 332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  55.3 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  55.3 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  57 
 
 		 325 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  57.05 
 
 		 333 aa  332  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  56.51 
 
 		 327 aa  330  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  58.67 
 
 		 327 aa  330  3e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  56.05 
 
 		 356 aa  329  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  54.78 
 
 		 348 aa  328  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  55.41 
 
 		 350 aa  328  7e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  55.1 
 
 		 349 aa  326  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  53.7 
 
 		 355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  57.09 
 
 		 343 aa  325  6e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  55.81 
 
 		 351 aa  324  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  53.4 
 
 		 344 aa  324  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  53.99 
 
 		 358 aa  321  8e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  54.34 
 
 		 344 aa  321  9.000000000000001e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  55.15 
 
 		 354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  54.79 
 
 		 353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  55.15 
 
 		 350 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  56.25 
 
 		 329 aa  318  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  54.15 
 
 		 356 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  52.05 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  52.43 
 
 		 345 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  51.27 
 
 		 325 aa  315  7e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  53.56 
 
 		 344 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  51.54 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  50.97 
 
 		 323 aa  294  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  53.29 
 
 		 321 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  54.27 
 
 		 323 aa  292  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  49.52 
 
 		 325 aa  291  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  49.83 
 
 		 318 aa  291  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  50.98 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  52.28 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  50.68 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  49.68 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  49.68 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  48.06 
 
 		 323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  48.68 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  51.79 
 
 		 320 aa  272  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  48.06 
 
 		 321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.78 
 
 		 346 aa  268  8.999999999999999e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.73 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  49.66 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.62 
 
 		 329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  47.06 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  44.04 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.08 
 
 		 322 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  44.48 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.05 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  44.76 
 
 		 322 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  40.8 
 
 		 444 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  40.07 
 
 		 472 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  38.31 
 
 		 412 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  37.11 
 
 		 464 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  39.61 
 
 		 474 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  38.49 
 
 		 455 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  38.16 
 
 		 455 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  38.05 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  36.79 
 
 		 449 aa  176  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  36.74 
 
 		 441 aa  176  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  36.71 
 
 		 442 aa  175  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  38.72 
 
 		 474 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  39.26 
 
 		 521 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  39.26 
 
 		 520 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  39.26 
 
 		 515 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  39.26 
 
 		 523 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  39.26 
 
 		 520 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  39.26 
 
 		 520 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  39.26 
 
 		 523 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  38.85 
 
 		 634 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  38.1 
 
 		 491 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  36.58 
 
 		 453 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  38.46 
 
 		 594 aa  172  9e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>