42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2325 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1885  hypothetical protein  96.75 
 
 		 369 aa  738    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2325  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  761    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2488  hypothetical protein  71.03 
 
 		 363 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.492113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2787  hypothetical protein  71.67 
 
 		 364 aa  519  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0048  hypothetical protein  57.58 
 
 		 365 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1451  hypothetical protein  55.8 
 
 		 372 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.553711  normal  0.492787 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0554  hypothetical protein  57.62 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0121  hypothetical protein  53.03 
 
 		 420 aa  388  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4880  hypothetical protein  52.39 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05900  hypothetical protein  53.56 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.598804 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2463  hypothetical protein  60.16 
 
 		 431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0026  hypothetical protein  40.16 
 
 		 367 aa  280  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0025  hypothetical protein  40.9 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0372  LOR/SDH bifunctional protein  37.43 
 
 		 415 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216176  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0465  LOR/SDH bifunctional protein  37.43 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0299  LOR/SDH bifunctional protein  37.43 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1005  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  36.81 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.538878  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0845  LOR/SDH bifunctional protein  35.47 
 
 		 417 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1454  LOR/SDH bifunctional protein  36.84 
 
 		 415 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0636  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  37.68 
 
 		 450 aa  195  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2692  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  36.39 
 
 		 410 aa  193  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0938  hypothetical protein  33.8 
 
 		 409 aa  192  9e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.182607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1445  LOR/SDH bifunctional protein  35.03 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0863  LOR/SDH bifunctional protein  35.55 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00957303 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0533  LOR/SDH bifunctional protein  35.96 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.990735  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1684  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  38.05 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0305327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1342  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  34.76 
 
 		 408 aa  180  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0795325  normal  0.948696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4864  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  35.65 
 
 		 412 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0701737 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0686  hypothetical protein  34.8 
 
 		 409 aa  179  8e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1408  LOR/SDH bifunctional protein  35.03 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000543179  normal  0.449844 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2149  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  35.17 
 
 		 440 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1826  LOR/SDH bifunctional protein  34.71 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.263588  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3107  LOR/SDH bifunctional protein  35.21 
 
 		 435 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  30.92 
 
 		 703 aa  162  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2163  hypothetical protein  33.04 
 
 		 405 aa  162  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106153  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  31.74 
 
 		 703 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  32.29 
 
 		 705 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  31.78 
 
 		 705 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  31.78 
 
 		 705 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  32.16 
 
 		 704 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  30.97 
 
 		 703 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3091  LOR/SDH bifunctional enzyme region  31.96 
 
 		 414 aa  142  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>