More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2291 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  54.55 
 
 
264 aa  256  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  51.79 
 
 
259 aa  254  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1074  ABC transporter related  55.56 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2008  ABC-type transport system, ATPase component  48.36 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.52 
 
 
240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2860  ABC transporter related  40.49 
 
 
242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.55 
 
 
609 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.55 
 
 
591 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2821  ABC transporter, ATPase subunit  38.03 
 
 
237 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341071  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  37.07 
 
 
242 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  39.92 
 
 
609 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  41.67 
 
 
507 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.66 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  38.71 
 
 
244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  37.8 
 
 
222 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.52 
 
 
502 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  40.17 
 
 
241 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.76 
 
 
258 aa  143  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.44 
 
 
344 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.42 
 
 
510 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 
335 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  36.68 
 
 
247 aa  142  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.83 
 
 
255 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  38.53 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  36.56 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  36.21 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  39.74 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  38.1 
 
 
355 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  37.07 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  36.91 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  38.63 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0838  ABC transporter related  36.21 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00107302  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0854  ABC transporter related  36.21 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171814  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2484  ABC transporter related  38.39 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000266476 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0029  ABC transporter related  36.84 
 
 
250 aa  139  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957294  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  38.66 
 
 
344 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5262  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 
335 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0489  ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.99 
 
 
516 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  38.08 
 
 
335 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6304  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.86 
 
 
335 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  40.59 
 
 
385 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  36.55 
 
 
342 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  37.45 
 
 
351 aa  138  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1056  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  31.52 
 
 
350 aa  138  7e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0473283  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.52 
 
 
244 aa  138  7e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0065  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 
335 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  37.16 
 
 
261 aa  138  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  39.21 
 
 
243 aa  138  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  38.49 
 
 
335 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2365  ABC transporter related  39.17 
 
 
365 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0817479  hitchhiker  0.00312127 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  35.93 
 
 
339 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 
339 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2745  ABC transporter related  39.11 
 
 
248 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  35.93 
 
 
339 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  38 
 
 
377 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2718  ABC transporter related  38.82 
 
 
263 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.17 
 
 
335 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 
339 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  36.36 
 
 
243 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  37.39 
 
 
243 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.53 
 
 
240 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  33.63 
 
 
243 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3336  ABC transporter related  40.71 
 
 
264 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.314642  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1772  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.57 
 
 
348 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  36.36 
 
 
243 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  36.8 
 
 
247 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72620  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.86 
 
 
335 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  33.63 
 
 
243 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 
240 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 
331 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  41.32 
 
 
640 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1027  ABC transporter related  38.22 
 
 
242 aa  137  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0179899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  36.64 
 
 
340 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3652  ABC transporter related  37.77 
 
 
339 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  35.89 
 
 
286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  35.22 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.37 
 
 
369 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  37.78 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 
339 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1658  ABC transporter related  36.6 
 
 
254 aa  136  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.56 
 
 
240 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  35.63 
 
 
248 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1080  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.57 
 
 
363 aa  136  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  34.87 
 
 
255 aa  135  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  35.5 
 
 
339 aa  135  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  34.56 
 
 
258 aa  135  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  39.66 
 
 
250 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  35.68 
 
 
247 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  34.9 
 
 
244 aa  135  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  38.56 
 
 
247 aa  135  5e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  38.79 
 
 
342 aa  135  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  35.5 
 
 
339 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>