24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2284 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2284  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  889    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000344842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1933  hypothetical protein  77.06 
 
 
434 aa  628  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000351856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  43.04 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  38.38 
 
 
454 aa  279  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  39.21 
 
 
472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_009483  Gura_0656  hypothetical protein  39.69 
 
 
462 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000988469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  40.13 
 
 
457 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2187  hypothetical protein  32.18 
 
 
502 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.080107  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0521  LamB porin family protein, putative  33.05 
 
 
464 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000174972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  32.96 
 
 
433 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0557  hypothetical protein  34.99 
 
 
452 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000338101  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3257  LamB porin family protein, putative  28.6 
 
 
493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000051646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1309  hypothetical protein  32.53 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  29.86 
 
 
447 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  28.98 
 
 
448 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0582  hypothetical protein  30.68 
 
 
505 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000609741  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  28.8 
 
 
464 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  32.37 
 
 
534 aa  53.9  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0310  hypothetical protein  28.89 
 
 
439 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000163597  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0011  hypothetical protein  35.96 
 
 
435 aa  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177215  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2562  hypothetical protein  30.3 
 
 
474 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382555 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  24.86 
 
 
542 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  44.29 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2177  hypothetical protein  28.57 
 
 
476 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00360265  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>