More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2181 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 190 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  93.16 
 
 		 190 aa  371  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  62.77 
 
 		 192 aa  263  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  65.24 
 
 		 200 aa  260  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  59.26 
 
 		 189 aa  248  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  63.44 
 
 		 194 aa  248  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  58.51 
 
 		 189 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  58.51 
 
 		 189 aa  241  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  57.22 
 
 		 188 aa  240  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  58.51 
 
 		 190 aa  234  6e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  55.85 
 
 		 188 aa  231  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.32 
 
 		 189 aa  229  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  55.03 
 
 		 189 aa  224  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.84 
 
 		 190 aa  222  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  52.63 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.13 
 
 		 189 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  50.79 
 
 		 191 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  51.58 
 
 		 190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  50 
 
 		 189 aa  202  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.94 
 
 		 195 aa  192  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  38.62 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  40 
 
 		 195 aa  148  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  38.1 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  38.5 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  36.98 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.57 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  35.56 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  39.04 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  33.33 
 
 		 194 aa  121  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  32.8 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  36.52 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  33.87 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  35.45 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.98 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  35.03 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  33.13 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  33.13 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.53 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.2 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.53 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.03 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.58 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  31.51 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  31.17 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  29.82 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.58 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  30.94 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  28.03 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  29.24 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.66 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.48 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  25.73 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.2 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.61 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.82 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  31.21 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  24.85 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.03 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  28.02 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.26 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  32.35 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  28.08 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  29.79 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  29.45 
 
 		 287 aa  68.6  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  29.59 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  28.41 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  31.01 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  29.25 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  25.43 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  29.56 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.07 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  25.73 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  25.73 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  33.1 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  24.71 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  25.29 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  25.44 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  26.47 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  26.59 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1051  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.81 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.136443 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.41 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  25.73 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.3 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  28.49 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.85 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  30 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1553  hypothetical protein  26.62 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  26.11 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.52 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  25.15 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  25.58 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.13 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  28.08 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  28.66 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  29.37 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  25.15 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  25.15 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  29.41 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>