More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2131 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  58.76 
 
 
656 aa  775    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  57.21 
 
 
661 aa  794    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  89.27 
 
 
663 aa  1209    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  61.36 
 
 
664 aa  821    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  59.12 
 
 
658 aa  795    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  57.55 
 
 
659 aa  813    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  58.73 
 
 
658 aa  822    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  61.07 
 
 
655 aa  819    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  54.63 
 
 
655 aa  729    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  56.41 
 
 
661 aa  822    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  61.05 
 
 
664 aa  804    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
663 aa  1368    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  60.15 
 
 
656 aa  781    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  60.46 
 
 
652 aa  848    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  58.79 
 
 
658 aa  798    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.56 
 
 
711 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  36.28 
 
 
678 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  39.16 
 
 
678 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  38.19 
 
 
711 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.41 
 
 
683 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.05 
 
 
711 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.03 
 
 
694 aa  445  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.49 
 
 
699 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.86 
 
 
712 aa  435  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.32 
 
 
698 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.17 
 
 
699 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.39 
 
 
694 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  35.82 
 
 
699 aa  420  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.26 
 
 
676 aa  422  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  33.14 
 
 
703 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.97 
 
 
686 aa  418  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  36.78 
 
 
716 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  37.41 
 
 
671 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  38 
 
 
661 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.6 
 
 
722 aa  412  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  32.81 
 
 
703 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  32.81 
 
 
703 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  33.19 
 
 
703 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  32.81 
 
 
703 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  32.81 
 
 
703 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.24 
 
 
717 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  32.81 
 
 
703 aa  405  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  32.81 
 
 
703 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  32.81 
 
 
703 aa  405  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  35.61 
 
 
661 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  32.81 
 
 
703 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  34.73 
 
 
716 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0698  putative iron-sulfur-binding reductase  35.45 
 
 
714 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0314835  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  36.97 
 
 
663 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.55 
 
 
737 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.46 
 
 
662 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  36.17 
 
 
683 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  33.84 
 
 
739 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  35.45 
 
 
661 aa  392  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  34.23 
 
 
629 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.06 
 
 
762 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  35.41 
 
 
1033 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.1 
 
 
662 aa  389  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.85 
 
 
722 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.48 
 
 
714 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  33.75 
 
 
743 aa  385  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  35.37 
 
 
718 aa  382  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  34.34 
 
 
882 aa  382  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  35.06 
 
 
732 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.83 
 
 
661 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.7 
 
 
748 aa  379  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  33.29 
 
 
727 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0619  hypothetical protein  34.54 
 
 
1027 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321206  normal  0.108108 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.63 
 
 
661 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0442  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  35.24 
 
 
1046 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0429  hypothetical protein  35.24 
 
 
1042 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.811487  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2517  hypothetical protein  35.72 
 
 
662 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0452  hypothetical protein  35.24 
 
 
1046 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.506631  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0278  hypothetical protein  33.47 
 
 
1044 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.38 
 
 
721 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.23 
 
 
713 aa  365  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.48 
 
 
758 aa  363  7.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.48 
 
 
679 aa  357  2.9999999999999997e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  33.85 
 
 
762 aa  356  7.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  40.27 
 
 
1388 aa  345  2e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5262  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.61 
 
 
737 aa  345  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1708  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.56 
 
 
641 aa  342  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0465  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.17 
 
 
1131 aa  341  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  29.2 
 
 
752 aa  339  9e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  30.92 
 
 
727 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  31.68 
 
 
688 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  30.35 
 
 
730 aa  335  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.39 
 
 
774 aa  334  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0874  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  31.1 
 
 
989 aa  331  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  normal  0.996162 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  31.3 
 
 
692 aa  331  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  32.94 
 
 
683 aa  329  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4337  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.33 
 
 
1215 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  31.98 
 
 
703 aa  316  7e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  36.4 
 
 
654 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0971  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.44 
 
 
723 aa  302  1e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3824  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.41 
 
 
728 aa  299  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.676113  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0501  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.89 
 
 
724 aa  298  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.17587  normal  0.555543 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0042  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29 
 
 
738 aa  296  9e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0933  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.4 
 
 
695 aa  291  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271519  normal  0.676616 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5959  hypothetical protein  29.54 
 
 
720 aa  291  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0717248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>