38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1978 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  332  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  89.7 
 
 		 165 aa  308  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  34.59 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4081  hypothetical protein  41.33 
 
 		 273 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000218694  normal  0.0348171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3394  hypothetical protein  36.89 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3444  hypothetical protein  35.64 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000353163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0293  hypothetical protein  37.62 
 
 		 328 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000169852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  30.18 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0109  hypothetical protein  41.86 
 
 		 321 aa  60.8  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  28 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4028  hypothetical protein  40.43 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1640  hypothetical protein  36.7 
 
 		 319 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0140573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2234  hypothetical protein  37.14 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.143589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1713  hypothetical protein  36.7 
 
 		 319 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0219056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  33.04 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  32.88 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  31.43 
 
 		 329 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  26.61 
 
 		 288 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  28.06 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  26.78 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  27.27 
 
 		 353 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  28.48 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  24.51 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4329  hypothetical protein  32.53 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69784 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  26.79 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1284  hypothetical protein  23.62 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190603  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  22.64 
 
 		 255 aa  45.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  44.3  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  29.07 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  29.09 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1053  hypothetical protein  29.31 
 
 		 192 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.308187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0935  hypothetical protein  29.31 
 
 		 192 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.879201  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  30.23 
 
 		 267 aa  41.6  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0793  hypothetical protein  30 
 
 		 232 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0248142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0796  hypothetical protein  30 
 
 		 246 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.625829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3326  carbohydrate-binding family V/XII protein  26.56 
 
 		 794 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  24.03 
 
 		 170 aa  41.2  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  30.59 
 
 		 171 aa  40.8  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>