More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1935 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
275 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  97.45 
 
 
275 aa  528  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  63.87 
 
 
275 aa  333  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  60.22 
 
 
275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  57.99 
 
 
276 aa  294  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  57.58 
 
 
271 aa  277  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  53.03 
 
 
271 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  49.62 
 
 
264 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  46.9 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  41.98 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  41.11 
 
 
272 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  41.04 
 
 
266 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  41.04 
 
 
267 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  41.2 
 
 
266 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  41.04 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  43.3 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  39.47 
 
 
293 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  39.08 
 
 
285 aa  188  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  39.08 
 
 
285 aa  188  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  38.01 
 
 
294 aa  188  9e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  45 
 
 
263 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  39.33 
 
 
268 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 
297 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 
297 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 
292 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  39.03 
 
 
290 aa  186  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 
268 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  40.38 
 
 
268 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  39.78 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  38.95 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  39.92 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  40 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  41.57 
 
 
288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 
284 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  38.61 
 
 
259 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  42.8 
 
 
284 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  42.8 
 
 
284 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 
272 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 
290 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  38.64 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  38.95 
 
 
268 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  39.23 
 
 
267 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  38.95 
 
 
268 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  38.91 
 
 
273 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  39.77 
 
 
268 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  41.44 
 
 
257 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  38.18 
 
 
297 aa  176  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 
268 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 
268 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 
268 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  39.77 
 
 
268 aa  175  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 
282 aa  175  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  38.2 
 
 
267 aa  175  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 
269 aa  175  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 
296 aa  175  9e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  42.96 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  39.77 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  38.11 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3685  dimethyladenosine transferase  41.7 
 
 
284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.401962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  38.81 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6886  dimethyladenosine transferase  41.2 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  37.88 
 
 
295 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  38.85 
 
 
291 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  41.76 
 
 
299 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  39.34 
 
 
278 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 
267 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 
268 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  38.95 
 
 
267 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 
285 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  38.85 
 
 
262 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 
266 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  35.58 
 
 
266 aa  169  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  36.06 
 
 
294 aa  169  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  40.38 
 
 
265 aa  168  8e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 
267 aa  168  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 
278 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 
262 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  36.6 
 
 
291 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  34.7 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  38.6 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  37.97 
 
 
263 aa  166  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 
268 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  35.85 
 
 
297 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>