More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1905 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  81.69 
 
 		 694 aa  1198    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  46.97 
 
 		 692 aa  659    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  47.94 
 
 		 691 aa  673    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  78.54 
 
 		 697 aa  1127    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  49.63 
 
 		 692 aa  691    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  45.04 
 
 		 673 aa  642    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  44.56 
 
 		 693 aa  636    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  46.96 
 
 		 698 aa  649    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  47.23 
 
 		 695 aa  673    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  47.88 
 
 		 691 aa  672    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  47.97 
 
 		 692 aa  677    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  47.02 
 
 		 700 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  46.69 
 
 		 691 aa  638    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  45.32 
 
 		 692 aa  653    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  46.8 
 
 		 698 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  48.08 
 
 		 692 aa  674    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  48.08 
 
 		 692 aa  674    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  50 
 
 		 688 aa  657    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  48.08 
 
 		 692 aa  674    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  49.27 
 
 		 689 aa  690    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  50.15 
 
 		 687 aa  677    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  46.94 
 
 		 694 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  46.94 
 
 		 694 aa  652    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  46.04 
 
 		 697 aa  650    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  47.62 
 
 		 704 aa  639    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  79.17 
 
 		 697 aa  1172    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  51.45 
 
 		 692 aa  752    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  97.72 
 
 		 701 aa  1420    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  46.02 
 
 		 693 aa  650    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  44.94 
 
 		 670 aa  646    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  49.49 
 
 		 686 aa  687    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  46.88 
 
 		 697 aa  657    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  45.95 
 
 		 692 aa  655    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  59.97 
 
 		 692 aa  870    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  48.08 
 
 		 692 aa  674    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  45.47 
 
 		 695 aa  641    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  50.87 
 
 		 688 aa  694    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  47.79 
 
 		 692 aa  674    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  47.64 
 
 		 692 aa  671    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  47.52 
 
 		 679 aa  676    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  49.04 
 
 		 692 aa  680    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  76.93 
 
 		 697 aa  1135    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  47.06 
 
 		 689 aa  651    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  50.59 
 
 		 686 aa  699    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  48.08 
 
 		 692 aa  674    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  47.27 
 
 		 700 aa  644    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  50 
 
 		 691 aa  702    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  46.53 
 
 		 697 aa  648    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  46.79 
 
 		 691 aa  660    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  49.78 
 
 		 680 aa  683    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  50.15 
 
 		 692 aa  695    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  47.12 
 
 		 692 aa  660    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  46.33 
 
 		 697 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  48.4 
 
 		 698 aa  641    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  48.68 
 
 		 689 aa  682    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  46.59 
 
 		 697 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  100 
 
 		 701 aa  1447    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  47.46 
 
 		 700 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  47.83 
 
 		 701 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  47.3 
 
 		 690 aa  666    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  47.15 
 
 		 697 aa  645    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  45.93 
 
 		 698 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  47.79 
 
 		 692 aa  672    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  44.56 
 
 		 699 aa  641    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  45.95 
 
 		 697 aa  641    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  47.55 
 
 		 701 aa  684    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  48.46 
 
 		 685 aa  639    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  46.89 
 
 		 691 aa  654    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  48.24 
 
 		 695 aa  682    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  44.77 
 
 		 699 aa  635    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002299  translation elongation factor G  47.17 
 
 		 699 aa  649    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000315857  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  44.56 
 
 		 699 aa  641    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  48.23 
 
 		 691 aa  660    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  47.95 
 
 		 689 aa  691    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  49.12 
 
 		 692 aa  692    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  48.08 
 
 		 692 aa  675    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  48.97 
 
 		 692 aa  675    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  48.13 
 
 		 703 aa  641    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  46.69 
 
 		 691 aa  654    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  49.49 
 
 		 697 aa  686    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  45.49 
 
 		 698 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  47.74 
 
 		 682 aa  683    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  46.91 
 
 		 692 aa  668    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  48.82 
 
 		 691 aa  671    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  47.22 
 
 		 692 aa  642    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  45.89 
 
 		 697 aa  659    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  45.03 
 
 		 693 aa  649    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  47.88 
 
 		 692 aa  670    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  45.89 
 
 		 697 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  45.24 
 
 		 673 aa  642    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  56.56 
 
 		 691 aa  805    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  45.66 
 
 		 707 aa  660    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  47.35 
 
 		 692 aa  668    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  46.61 
 
 		 688 aa  651    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  48.91 
 
 		 691 aa  694    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  48.82 
 
 		 692 aa  678    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  84.74 
 
 		 694 aa  1229    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  49.41 
 
 		 692 aa  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  47.17 
 
 		 700 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  46.51 
 
 		 698 aa  643    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>