More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1891 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  80.77 
 
 
467 aa  810    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
477 aa  983    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  69.79 
 
 
468 aa  704    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  78.85 
 
 
466 aa  794    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  98.95 
 
 
477 aa  977    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  88.35 
 
 
474 aa  875    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  79.24 
 
 
475 aa  798    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  76.65 
 
 
474 aa  766    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  61.42 
 
 
485 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  61.42 
 
 
485 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  61.64 
 
 
485 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  59.06 
 
 
476 aa  580  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  60.69 
 
 
484 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  58.15 
 
 
482 aa  567  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  59.78 
 
 
481 aa  558  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  59.78 
 
 
475 aa  557  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  57.96 
 
 
511 aa  542  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  56.55 
 
 
487 aa  542  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
461 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
517 aa  533  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  53.41 
 
 
514 aa  531  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
488 aa  528  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  57.64 
 
 
466 aa  528  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  55.04 
 
 
469 aa  526  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
488 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  53.91 
 
 
486 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  54.42 
 
 
490 aa  527  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  53.68 
 
 
503 aa  521  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  53.48 
 
 
502 aa  521  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  52.78 
 
 
493 aa  523  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  55.19 
 
 
474 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  54.42 
 
 
462 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  52.65 
 
 
451 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  54.57 
 
 
463 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  53.83 
 
 
462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
480 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  53.63 
 
 
491 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  53.69 
 
 
467 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  53.86 
 
 
470 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  53.11 
 
 
514 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  51.73 
 
 
500 aa  513  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  51.07 
 
 
500 aa  512  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  51.07 
 
 
499 aa  512  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  52.75 
 
 
509 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  51.88 
 
 
471 aa  508  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  51.88 
 
 
471 aa  508  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  51.88 
 
 
471 aa  508  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  53.19 
 
 
491 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  51.88 
 
 
471 aa  508  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  53.58 
 
 
472 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  52.54 
 
 
501 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  51.88 
 
 
471 aa  508  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  53.19 
 
 
491 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  52.11 
 
 
471 aa  509  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  51.66 
 
 
471 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0122  amidophosphoribosyltransferase  54.78 
 
 
467 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  51.66 
 
 
471 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  52.33 
 
 
471 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  53.45 
 
 
470 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  52.88 
 
 
495 aa  507  9.999999999999999e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 
487 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  52.97 
 
 
491 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  52.23 
 
 
491 aa  503  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  51.44 
 
 
471 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  51.44 
 
 
471 aa  504  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  53.68 
 
 
496 aa  504  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  53.03 
 
 
503 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  52.85 
 
 
475 aa  501  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  51.66 
 
 
478 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  54.63 
 
 
478 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  53.52 
 
 
465 aa  498  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
480 aa  501  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  50.99 
 
 
497 aa  495  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  53.98 
 
 
502 aa  494  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  50.75 
 
 
486 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
474 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  50.64 
 
 
510 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  51.31 
 
 
487 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  51.51 
 
 
508 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  52.61 
 
 
496 aa  492  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  52.72 
 
 
499 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  51.31 
 
 
487 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  51.28 
 
 
496 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  51.06 
 
 
529 aa  491  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  52.97 
 
 
514 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0174  amidophosphoribosyltransferase  52.35 
 
 
445 aa  488  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.838457  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  52.29 
 
 
506 aa  486  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  50.75 
 
 
496 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  50.64 
 
 
496 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2908  amidophosphoribosyltransferase  48.95 
 
 
515 aa  483  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60952  normal  0.814875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  51.72 
 
 
496 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  50.44 
 
 
475 aa  481  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  50.45 
 
 
506 aa  482  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  50.22 
 
 
503 aa  480  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  50.53 
 
 
484 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06050  amidophosphoribosyltransferase  50.76 
 
 
518 aa  478  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.203247  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  51.21 
 
 
493 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
479 aa  481  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  51.23 
 
 
446 aa  481  1e-134  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
494 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>