206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1886 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1886  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
257 aa  524  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2334  beta-lactamase domain protein  98.05 
 
 
257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.577131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2063  beta-lactamase domain-containing protein  64.17 
 
 
256 aa  346  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1944  Beta-lactamase-like  61.75 
 
 
261 aa  316  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1631  metallo-beta-lactamase family protein  60.56 
 
 
256 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0446531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2693  beta-lactamase domain protein  54.51 
 
 
256 aa  289  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.552657  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1144  beta-lactamase domain-containing protein  53.33 
 
 
256 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1329  beta-lactamase superfamily hydrolase  51.97 
 
 
256 aa  259  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1236  beta-lactamase domain-containing protein  42.97 
 
 
260 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3027  beta-lactamase domain-containing protein  48.68 
 
 
268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2799  beta-lactamase domain-containing protein  44.54 
 
 
264 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00920301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2782  beta-lactamase domain protein  45.06 
 
 
258 aa  198  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.492368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4326  beta-lactamase-like  43.02 
 
 
265 aa  192  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.111759  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20260  beta-lactamase domain protein  39.84 
 
 
263 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2896  beta-lactamase domain protein  43.81 
 
 
261 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1895  beta-lactamase domain-containing protein  45.22 
 
 
261 aa  185  8e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2327  beta-lactamase-like protein  39.17 
 
 
263 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000211578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2644  beta-lactamase domain protein  38.02 
 
 
256 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2153  beta-lactamase domain-containing protein  44.64 
 
 
262 aa  180  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4916  beta-lactamase domain protein  38.31 
 
 
270 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2814  beta-lactamase-like protein  43.35 
 
 
263 aa  176  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.376586  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2918  beta-lactamase domain protein  41.35 
 
 
268 aa  176  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2313  beta-lactamase domain-containing protein  41.08 
 
 
259 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00657637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3388  beta-lactamase domain protein  39.11 
 
 
263 aa  175  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07370  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily I  38.93 
 
 
266 aa  175  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.118565  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1139  Beta-lactamase-like  41.96 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000269692  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2881  beta-lactamase-like  41.35 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.252377  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51250  hypothetical protein  40.65 
 
 
252 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188489 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4002  beta-lactamase domain-containing protein  36.97 
 
 
264 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5255  beta-lactamase domain-containing protein  36.97 
 
 
264 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1100  hypothetical protein  41.95 
 
 
252 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.947825  normal  0.67239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3534  beta-lactamase domain protein  36.1 
 
 
264 aa  168  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5585  metallo-beta-lactamase family protein  36.55 
 
 
264 aa  168  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5350  metallo-beta-lactamase family protein  36.55 
 
 
264 aa  168  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000218111  hitchhiker  0.00000000000000228298 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5611  metallo-beta-lactamase family protein  36.55 
 
 
264 aa  168  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5646  metallo-beta-lactamase family protein  36.55 
 
 
264 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0604366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5315  metallo-beta-lactamase family protein  36.55 
 
 
264 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5143  zinc-dependent hydrolase  36.55 
 
 
264 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5159  metallo-beta-lactamase family protein  36.55 
 
 
264 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5568  metallo-beta-lactamase family protein  36.55 
 
 
264 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.62183e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5711  metallo-beta-lactamase family protein  36.55 
 
 
264 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2443  hypothetical protein  38.91 
 
 
285 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0648  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 
259 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0841  beta-lactamase-like protein  40.97 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000232036  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0985  beta-lactamase-like protein  40.97 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000377257  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0232  beta-lactamase domain protein  40.71 
 
 
263 aa  166  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0848  Beta-lactamase-like  40.66 
 
 
255 aa  165  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.701692  hitchhiker  0.00132369 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0721  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.1 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3405  beta-lactamase domain protein  35.37 
 
 
264 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106326  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1114  beta-lactamase superfamily hydrolase  36.29 
 
 
270 aa  161  9e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2530  metallo-beta-lactamase family protein YycJ  34.58 
 
 
266 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.22966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0022  beta-lactamase domain-containing protein  34.58 
 
 
266 aa  158  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0022  beta-lactamase domain-containing protein  34.58 
 
 
266 aa  158  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0111  hypothetical protein  36.32 
 
 
262 aa  157  1e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1887  beta-lactamase domain protein  39.48 
 
 
273 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000106131 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2932  metallo-beta-lactamase family protein  34.43 
 
 
263 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0441  beta-lactamase superfamily hydrolase  37.12 
 
 
270 aa  155  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2615  metallo-beta-lactamase family protein  34.43 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0942  beta-lactamase domain protein  36.1 
 
 
267 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2546  beta-lactamase domain protein  40.26 
 
 
257 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102753  normal  0.0179239 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0068  beta-lactamase superfamily hydrolase  36.13 
 
 
265 aa  155  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0631  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
265 aa  154  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1147  hypothetical protein  40.17 
 
 
261 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.385681  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1550  Beta-lactamase-like  37.6 
 
 
252 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294376  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1070  beta-lactamase-like protein  36.58 
 
 
262 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.941364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3973  beta-lactamase domain-containing protein  38.59 
 
 
252 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0023  beta-lactamase domain-containing protein  36.82 
 
 
268 aa  154  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3951  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.6 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00829584  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4385  hypothetical protein  39.57 
 
 
236 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1587  putative metallo-beta-lactamase family protein  39.39 
 
 
257 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4179  beta-lactamase domain-containing protein  38.17 
 
 
252 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1373  Beta-lactamase-like  39.38 
 
 
253 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0829  beta-lactamase domain protein  38.43 
 
 
260 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1269  beta-lactamase domain-containing protein  38.17 
 
 
252 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.914297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1425  beta-lactamase domain-containing protein  39.83 
 
 
257 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101426  normal  0.203136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1239  beta-lactamase domain protein  38.17 
 
 
252 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.668505  normal  0.852311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3434  beta-lactamase domain protein  39.3 
 
 
258 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0989  beta-lactamase domain protein  38.26 
 
 
261 aa  148  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183527  normal  0.269998 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1085  beta-lactamase domain protein  38.26 
 
 
261 aa  148  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0472952  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5984  beta-lactamase-like  40.79 
 
 
258 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147064  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2111  beta-lactamase domain-containing protein  40.79 
 
 
258 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.234002  hitchhiker  0.00376892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2093  beta-lactamase domain-containing protein  40.79 
 
 
258 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204036  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0438  beta-lactamase domain protein  32.76 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1106  Beta-lactamase-like  39.56 
 
 
262 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4997  beta-lactamase domain protein  34.5 
 
 
273 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101352  normal  0.026675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2003  beta-lactamase domain-containing protein  39.47 
 
 
258 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.645635  hitchhiker  0.0000000218152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2130  beta-lactamase domain-containing protein  39.47 
 
 
258 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163194  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1563  beta-lactamase domain-containing protein  36.96 
 
 
267 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.482426 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0105  beta-lactamase domain protein  35.44 
 
 
280 aa  143  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.590593 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5399  Beta-lactamase-like  39.21 
 
 
258 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00646528  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1008  beta-lactamase domain-containing protein  39.42 
 
 
260 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0922  beta-lactamase domain protein  39.42 
 
 
260 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3811  beta-lactamase domain-containing protein  37.34 
 
 
269 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2620  beta-lactamase-like  37.99 
 
 
258 aa  141  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0431697  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1181  beta-lactamase domain-containing protein  38.65 
 
 
258 aa  141  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0988621  hitchhiker  0.00000250799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1335  beta-lactamase domain-containing protein  38.31 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1050  beta-lactamase domain protein  36.04 
 
 
255 aa  138  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2696  metallo-beta-lactamase family protein  38.67 
 
 
258 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2617  metallo-beta-lactamase family protein  38.67 
 
 
258 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1451  metallo-beta-lactamase family protein  38.67 
 
 
258 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>