More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1846 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  100 
 
 		 172 aa  348  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  90.7 
 
 		 172 aa  325  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  68.6 
 
 		 176 aa  254  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  63.37 
 
 		 195 aa  229  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  59.88 
 
 		 182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  52.33 
 
 		 176 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  53.85 
 
 		 170 aa  194  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  56.29 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  51.16 
 
 		 173 aa  185  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  46.51 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  44.77 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  48.84 
 
 		 175 aa  164  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  42.35 
 
 		 184 aa  134  9e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  37.79 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  35.71 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  35.67 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  39.38 
 
 		 171 aa  101  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  33.33 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  33.33 
 
 		 166 aa  98.6  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  35.95 
 
 		 163 aa  97.4  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  31.61 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  33.72 
 
 		 169 aa  95.9  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  29.55 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  38.01 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  33.14 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  34.19 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.95 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  33.52 
 
 		 169 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  34.48 
 
 		 174 aa  91.3  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  31.61 
 
 		 169 aa  90.9  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  35.15 
 
 		 178 aa  89  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  28.98 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  29.24 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  28.41 
 
 		 173 aa  87.8  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  33.55 
 
 		 278 aa  87.8  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  32.74 
 
 		 167 aa  87.4  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  30.46 
 
 		 169 aa  87.4  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  29.89 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  29.89 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  31.03 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  27.84 
 
 		 173 aa  85.5  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  32.35 
 
 		 186 aa  84.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  32.68 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  33.12 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  35.8 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  27.01 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  32.92 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  33.54 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  30.29 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.41 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.59 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  29.53 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  30.77 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  31.74 
 
 		 180 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  30.82 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  30 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  33.56 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  28.48 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.12 
 
 		 190 aa  72  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  25.91 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.68 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  26.49 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  31.82 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.57 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  29.21 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.44 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  30.13 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  30.87 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.79 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  36.16 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  27.27 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.84 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.84 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  27.53 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  32.4 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  31.45 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  27.54 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.28 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.32 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  31.17 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  31.21 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.41 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  27.85 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  32.26 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  28.3 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.28 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.81 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  26.82 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  26.11 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  27.74 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  28.57 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  27.06 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  30.29 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  30.43 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.11 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  26.88 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  28.4 
 
 		 262 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  27.27 
 
 		 188 aa  62  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  31.21 
 
 		 263 aa  62  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>