More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1838 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1838  CheW protein  100 
 
 		 177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00299326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2380  CheW protein  96.02 
 
 		 177 aa  339  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  59.2 
 
 		 182 aa  205  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  35.16 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  33.09 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  30.52 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  31.21 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  27.46 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  31.88 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  29.75 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  29.08 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  27.33 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.57 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  28.57 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  27.86 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  29.08 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.57 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  28.37 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.79 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  26.43 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  31.82 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  35 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  29.79 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  29.08 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  26.57 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  29.33 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  29.08 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  27.7 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  29.85 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.66 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  28.06 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  26.43 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  27.27 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  26.8 
 
 		 344 aa  67.8  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.43 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  26.43 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  26.43 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  25.93 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  27.74 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  33.79 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  26.43 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  29.25 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  27.14 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  37.23 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  26.43 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  27.86 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  26.79 
 
 		 515 aa  66.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  29.25 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  28.38 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  26.47 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  27.34 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  28.57 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  26.53 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  25.71 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  26.67 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  29.37 
 
 		 325 aa  65.1  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  29.84 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  28.57 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  31.13 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  29.28 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  25 
 
 		 907 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  22.45 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  30.22 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  25.76 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  27.81 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  28.77 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0644  CheW protein  30.4 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.35775  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  26.25 
 
 		 518 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  25.74 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  26.92 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0610  CheW protein  29.6 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  26.12 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  29.03 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0751  CheW protein  26.09 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  26.09 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  28.99 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0635  CheW protein  29.6 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  29.93 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  27.35 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  24.65 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  29.03 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.35 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  30.6 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  28.89 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  29.5 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  28.78 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  25.47 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  29.14 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  25.37 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  25.17 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  23.94 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  30.34 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>