83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1831 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1831  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 283 aa  569  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2388  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  95.82 
 
 		 283 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0995379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1965  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  45.26 
 
 		 298 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0577  hypothetical protein  43.62 
 
 		 285 aa  225  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1359  hypothetical protein  43.17 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2901  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  44.44 
 
 		 289 aa  215  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1177  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  44.36 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3118  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  44.53 
 
 		 282 aa  202  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0882  hypothetical protein  43.01 
 
 		 290 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.960204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  39.46 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  39.44 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  37.16 
 
 		 336 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  32.39 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  26.59 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  25.42 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  25 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  25.4 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  29.79 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  22.31 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  26.96 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  25.42 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  25.25 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  25.41 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  26.96 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  29.41 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.3 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  21.8 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  26.47 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  26.47 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  26.47 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  23.67 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  25.41 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  21.32 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.47 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  24.51 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  25.85 
 
 		 370 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  23.64 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  22.38 
 
 		 329 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  23.57 
 
 		 333 aa  53.1  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  25.1 
 
 		 323 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.98 
 
 		 323 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  22.03 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  25.98 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  25.49 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.98 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  21.13 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.98 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  24.44 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.98 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.98 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  22.09 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  29.44 
 
 		 336 aa  50.4  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  26.03 
 
 		 324 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  23.33 
 
 		 317 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  27.71 
 
 		 344 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  23.33 
 
 		 317 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  25.11 
 
 		 319 aa  48.9  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  22.62 
 
 		 349 aa  48.9  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.49 
 
 		 323 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  28.29 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  26.87 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  22.22 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  23.63 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  24.5 
 
 		 584 aa  47  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2753  hypothetical protein  26.74 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.249359  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  23.85 
 
 		 329 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  26.61 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  23.55 
 
 		 317 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  22.06 
 
 		 317 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  23.21 
 
 		 326 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.43 
 
 		 321 aa  46.2  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  23.88 
 
 		 341 aa  45.8  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  21.74 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  20.97 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  24.03 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1116  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  34.43 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  21.78 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  26.06 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  24.67 
 
 		 332 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  21.94 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  23.56 
 
 		 328 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.01 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  26.49 
 
 		 384 aa  42.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>