More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1766 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 206 aa  424  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  96.12 
 
 		 212 aa  411  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  64.56 
 
 		 206 aa  287  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  60.7 
 
 		 206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  60.7 
 
 		 212 aa  252  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.62 
 
 		 208 aa  246  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  56.44 
 
 		 210 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  42.16 
 
 		 256 aa  161  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  44.61 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000282708  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  38.3 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  41.3 
 
 		 224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0404  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.61 
 
 		 224 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1666  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.07 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.695428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0604  hydrolase  35.15 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2173  HAD family hydrolase  40.32 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.07 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0660196 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.84 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  33.97 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  44.54 
 
 		 252 aa  77.8  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.18 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  44.54 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  44.54 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  44.54 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  44.54 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  44.54 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  44.54 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  44.54 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  34.2 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  43.7 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.77 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  29.5 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  29.57 
 
 		 223 aa  72  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  42.59 
 
 		 253 aa  72  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  44.68 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.1 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  43.62 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  32.46 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  25.37 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  29.8 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  25.89 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0492  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  29.8 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0923435  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  29.79 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  29.79 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  28.27 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  29.13 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  29.13 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1368  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  29.44 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.668908  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1247  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  29.8 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0333154  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  26 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  29.9 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  27.64 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.61 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.38 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  36.62 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  27.98 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.54 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  29.74 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  28.73 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  28.73 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  29.73 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  29.65 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.81 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  38.02 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  37.37 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  31.15 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.71 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.53 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  26.18 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  28.81 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  30.6 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  29.53 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  27.52 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  27.52 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  27.52 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0508  HAD family hydrolase  36.54 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13325  normal  0.112078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  27.52 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  27.45 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  27.37 
 
 		 217 aa  62  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43120  phosphoglycolate phosphatase, PGPase  26.47 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2045  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.13 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.13 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 239 aa  62  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  32.98 
 
 		 263 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>