More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1757 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  65.55 
 
 		 639 aa  867    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  93.97 
 
 		 645 aa  1235    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 647 aa  1325    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  66.25 
 
 		 643 aa  894    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  72.2 
 
 		 636 aa  958    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  68 
 
 		 642 aa  854    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  63.22 
 
 		 640 aa  770    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  46.06 
 
 		 619 aa  537  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  40.54 
 
 		 634 aa  479  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  40.99 
 
 		 646 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  41.61 
 
 		 597 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  40.18 
 
 		 609 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  38.22 
 
 		 645 aa  425  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  37.36 
 
 		 636 aa  412  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  37.6 
 
 		 691 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  37.24 
 
 		 600 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  35.2 
 
 		 755 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  38.38 
 
 		 673 aa  399  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  38.26 
 
 		 646 aa  399  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  37.08 
 
 		 631 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  37.56 
 
 		 648 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  36.6 
 
 		 630 aa  392  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  38.79 
 
 		 648 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  38.79 
 
 		 648 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  37.39 
 
 		 611 aa  388  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  35.91 
 
 		 646 aa  389  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  36.42 
 
 		 681 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  36.59 
 
 		 630 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  38.73 
 
 		 630 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  35.7 
 
 		 661 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  37.67 
 
 		 631 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  36.56 
 
 		 626 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  35.85 
 
 		 703 aa  385  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  36.61 
 
 		 629 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.13 
 
 		 618 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  36.1 
 
 		 629 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  36.19 
 
 		 801 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  36.1 
 
 		 629 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  36.1 
 
 		 629 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  35.95 
 
 		 640 aa  382  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  37.88 
 
 		 649 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  33.71 
 
 		 637 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  37.15 
 
 		 631 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  37.48 
 
 		 646 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  35.73 
 
 		 648 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  35.05 
 
 		 643 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  35.37 
 
 		 574 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  37.52 
 
 		 610 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.19 
 
 		 640 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  36.24 
 
 		 630 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1370  peptidoglycan glycosyltransferase  37.87 
 
 		 808 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0776138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  34.8 
 
 		 628 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  37.24 
 
 		 624 aa  375  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  36.32 
 
 		 646 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  35.02 
 
 		 640 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  34.15 
 
 		 602 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  35.77 
 
 		 650 aa  372  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  35.4 
 
 		 801 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  37.01 
 
 		 681 aa  372  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  36.5 
 
 		 619 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  35.63 
 
 		 630 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  35.23 
 
 		 800 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  37.54 
 
 		 595 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  35.24 
 
 		 801 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  36.17 
 
 		 627 aa  368  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  35.9 
 
 		 629 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  36.93 
 
 		 635 aa  369  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  35.73 
 
 		 667 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 		 618 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  35.73 
 
 		 631 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  34.19 
 
 		 617 aa  365  1e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  34.22 
 
 		 618 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  34.22 
 
 		 618 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  34.22 
 
 		 618 aa  365  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  34.11 
 
 		 618 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 		 629 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  35.71 
 
 		 803 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  34.11 
 
 		 618 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  36.91 
 
 		 655 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  34.11 
 
 		 618 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  34.11 
 
 		 618 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  35.48 
 
 		 679 aa  365  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  35.71 
 
 		 809 aa  364  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  35.71 
 
 		 803 aa  364  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  36.02 
 
 		 633 aa  364  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 		 678 aa  364  3e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 		 610 aa  364  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  34.88 
 
 		 612 aa  363  5.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  34.88 
 
 		 615 aa  363  6e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  35.89 
 
 		 655 aa  363  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  35.39 
 
 		 775 aa  362  9e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  33.68 
 
 		 617 aa  361  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  34.83 
 
 		 633 aa  361  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  34.34 
 
 		 640 aa  362  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1357  penicillin-binding protein 2  36.47 
 
 		 684 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.723027  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  35.71 
 
 		 802 aa  360  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  34.06 
 
 		 618 aa  360  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  35.07 
 
 		 637 aa  360  4e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  35.71 
 
 		 802 aa  360  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  35.71 
 
 		 802 aa  360  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>