More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1655 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
227 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  76.65 
 
 
227 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  65.94 
 
 
229 aa  310  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  66.22 
 
 
226 aa  309  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  65.5 
 
 
238 aa  296  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  57.08 
 
 
280 aa  281  9e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  57.94 
 
 
238 aa  277  9e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  60.44 
 
 
238 aa  274  7e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  55.79 
 
 
244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  55.13 
 
 
236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  56.84 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  57.51 
 
 
249 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  55.9 
 
 
393 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  48.91 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 
685 aa  212  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  48.47 
 
 
227 aa  211  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  48.67 
 
 
230 aa  210  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  46.93 
 
 
227 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  47.79 
 
 
230 aa  205  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0009  glycosyl transferase family 2  44.07 
 
 
271 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0011  glycosyl transferase family 2  44.07 
 
 
271 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  40.55 
 
 
519 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  40.94 
 
 
527 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
531 aa  191  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
527 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  46.29 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
230 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  44.14 
 
 
227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  43.5 
 
 
235 aa  174  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  42.34 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
234 aa  158  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
514 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  31.39 
 
 
410 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
298 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  30.45 
 
 
410 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.36 
 
 
410 aa  112  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 
355 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
304 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
411 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
287 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
284 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.14 
 
 
528 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
301 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
272 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  38.29 
 
 
228 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
374 aa  99  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  30.45 
 
 
285 aa  97.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
414 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0825  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
351 aa  97.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531655  normal  0.237079 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
340 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 
314 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 
305 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
420 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
257 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  29.87 
 
 
412 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
378 aa  96.7  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 
314 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  29.28 
 
 
309 aa  96.3  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
430 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
316 aa  96.7  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2243  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.4 
 
 
382 aa  95.5  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 
340 aa  95.5  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
394 aa  95.1  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  30.3 
 
 
406 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
394 aa  94.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
246 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5070  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
257 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  29.55 
 
 
276 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
312 aa  94  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04947  hypothetical protein similar to dolichol phosphate mannose synthase (Eurofung)  28.18 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0356269  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1630  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.3 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0121  b-glycosyltransferase  29.11 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
283 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
335 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
311 aa  91.7  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
448 aa  91.7  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
358 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  24.32 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1105  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000104847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.79 
 
 
246 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.95 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
319 aa  90.9  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
323 aa  89.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
347 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2018  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
391 aa  90.1  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
307 aa  89.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0151  methyltransferase type 12  27.62 
 
 
491 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319391  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
313 aa  89.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
229 aa  89.7  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
568 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  32.58 
 
 
247 aa  89.4  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
586 aa  89  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1323  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
247 aa  89  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000286825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2509  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.24 
 
 
254 aa  88.6  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  30.46 
 
 
310 aa  89  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  29.6 
 
 
243 aa  89  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>