More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1605 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 366 aa  746    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  94.81 
 
 		 366 aa  706    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  61.92 
 
 		 374 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  63.2 
 
 		 372 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  59.5 
 
 		 368 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  59.48 
 
 		 375 aa  418  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  55.65 
 
 		 368 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  45.21 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  43.65 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  36.97 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  38.92 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  37.53 
 
 		 423 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  37.6 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  40.05 
 
 		 400 aa  223  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  38.74 
 
 		 363 aa  219  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  41.43 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 347 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  34.97 
 
 		 393 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  38.38 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  37.81 
 
 		 383 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  35.41 
 
 		 470 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  35.41 
 
 		 475 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  35.41 
 
 		 475 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  35.84 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  37.71 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  39.71 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  37.71 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  36.52 
 
 		 460 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  38.51 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  37.43 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  36.52 
 
 		 460 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  37.43 
 
 		 390 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  36.16 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  40.88 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  39.47 
 
 		 387 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  34.96 
 
 		 366 aa  202  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  37.5 
 
 		 394 aa  202  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.725166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  39.24 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  38.79 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02540  multidrug efflux system  37.5 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  37.2 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  37.5 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2807  multidrug resistance protein A  37.5 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414824  hitchhiker  0.00826621 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02505  hypothetical protein  37.5 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  37.5 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  37.5 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  38.95 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  38.63 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  39.41 
 
 		 377 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  38.57 
 
 		 342 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  37.1 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 333 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  35.14 
 
 		 355 aa  199  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3191  multidrug resistance protein A  37.2 
 
 		 390 aa  199  9e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.168067  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 		 383 aa  199  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3120  multidrug resistance protein A  37.8 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0308659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 		 352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  37.93 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3014  multidrug resistance protein A  37.8 
 
 		 390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193784 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2962  multidrug resistance protein A  37.8 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  hitchhiker  0.00715907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  35.36 
 
 		 391 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2289  secretion protein HlyD family protein  45.12 
 
 		 348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  35.77 
 
 		 468 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2931  multidrug resistance protein A  37.8 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2997  multidrug resistance protein A  37.8 
 
 		 390 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 		 352 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2377  secretion protein HlyD family protein  45.12 
 
 		 348 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  36.04 
 
 		 349 aa  195  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 		 380 aa  195  9e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  37.07 
 
 		 351 aa  195  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  35.36 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  35.74 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  37.07 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  38.77 
 
 		 400 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  36.04 
 
 		 351 aa  193  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  35.67 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  36.31 
 
 		 401 aa  193  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  36.83 
 
 		 342 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  34.47 
 
 		 402 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  35.06 
 
 		 393 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  37.3 
 
 		 400 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  36.76 
 
 		 413 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  35.44 
 
 		 355 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  34.55 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  38.15 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  34.5 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  35.94 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  34.03 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  36.13 
 
 		 401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01156  multidrug resistance efflux pump  36.62 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  34.83 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1574  secretion protein HlyD  45.12 
 
 		 348 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>