148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1588 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  91.89 
 
 		 518 aa  942    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 518 aa  1050    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  55.38 
 
 		 520 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  53.92 
 
 		 525 aa  552  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  51.24 
 
 		 527 aa  521  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  49.51 
 
 		 519 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  48.41 
 
 		 517 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  42.36 
 
 		 521 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  39.96 
 
 		 520 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  39.57 
 
 		 520 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  40.85 
 
 		 520 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  36.78 
 
 		 523 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  36.92 
 
 		 510 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  37.91 
 
 		 527 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  38.03 
 
 		 508 aa  312  6.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  34.19 
 
 		 504 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  38.95 
 
 		 533 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  37.72 
 
 		 520 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  38.04 
 
 		 520 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  37.91 
 
 		 520 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  37.21 
 
 		 551 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  38.48 
 
 		 513 aa  299  7e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  36.17 
 
 		 518 aa  299  8e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  40.3 
 
 		 518 aa  297  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  38.78 
 
 		 502 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  36.64 
 
 		 518 aa  293  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  34.26 
 
 		 513 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  35.67 
 
 		 532 aa  291  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  39.03 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  34.26 
 
 		 513 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  36.38 
 
 		 526 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  35.94 
 
 		 520 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  39.76 
 
 		 529 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  39.92 
 
 		 516 aa  289  7e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  36.72 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  36.62 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  36.99 
 
 		 518 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  35.73 
 
 		 512 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  38.16 
 
 		 509 aa  279  9e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  33.01 
 
 		 530 aa  276  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  34.97 
 
 		 556 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  37.36 
 
 		 533 aa  275  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  35.64 
 
 		 540 aa  274  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0148  hypothetical protein  36.11 
 
 		 514 aa  270  5.9999999999999995e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  36.79 
 
 		 520 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  36.45 
 
 		 525 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  34.15 
 
 		 522 aa  259  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  37.24 
 
 		 544 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  35.04 
 
 		 509 aa  254  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  35.71 
 
 		 533 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  33.53 
 
 		 506 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  33.53 
 
 		 520 aa  243  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6932  hypothetical protein  37.12 
 
 		 523 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  38.15 
 
 		 533 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  36.15 
 
 		 498 aa  238  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  34.99 
 
 		 535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  34.38 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  35.51 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  34.44 
 
 		 497 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  34.11 
 
 		 579 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3305  hypothetical protein  33.53 
 
 		 537 aa  226  8e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13151  hypothetical protein  30.74 
 
 		 556 aa  226  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.309836 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  34.42 
 
 		 516 aa  220  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  34.42 
 
 		 516 aa  220  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  34.17 
 
 		 549 aa  220  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2257  hypothetical protein  34.43 
 
 		 584 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  hitchhiker  0.00613294 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0423  conserved hypothetical gluconokinase  36.22 
 
 		 325 aa  218  2e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  34.31 
 
 		 514 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  34.1 
 
 		 504 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  34.66 
 
 		 523 aa  210  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6936  hypothetical protein  38.66 
 
 		 494 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441597  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  34.86 
 
 		 523 aa  207  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  33.81 
 
 		 528 aa  200  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1384  hypothetical protein  31.56 
 
 		 490 aa  199  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.112089  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  34.89 
 
 		 499 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3211  hypothetical protein  33.26 
 
 		 603 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  32.8 
 
 		 526 aa  193  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1424  hypothetical protein  31.76 
 
 		 569 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5918  hypothetical protein  34.89 
 
 		 536 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.571754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  33.66 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3085  hypothetical protein  32.82 
 
 		 603 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2028  hypothetical protein  32.59 
 
 		 600 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1052  hypothetical protein  32.59 
 
 		 600 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1338  hypothetical protein  32.59 
 
 		 600 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2318  hypothetical protein  32.59 
 
 		 600 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469586  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  32.8 
 
 		 524 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  32.05 
 
 		 547 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1074  hypothetical protein  31.82 
 
 		 523 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1090  hypothetical protein  31.82 
 
 		 523 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1101  hypothetical protein  31.82 
 
 		 523 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0319349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2314  hypothetical protein  31.64 
 
 		 613 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1970  hypothetical protein  32.66 
 
 		 529 aa  179  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.971424  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0917  hypothetical protein  35.22 
 
 		 358 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7037  hypothetical protein  36.06 
 
 		 389 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12036  hypothetical protein  31.97 
 
 		 498 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6183  hypothetical protein  34.36 
 
 		 514 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.433204 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1349  hypothetical protein  32.37 
 
 		 521 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2221  hypothetical protein  31.88 
 
 		 520 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5926  hypothetical protein  36.2 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.768295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0391  hypothetical protein  33.44 
 
 		 345 aa  170  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>