97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1575 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1575  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  100 
 
 
222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2786  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  79.82 
 
 
222 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.478705  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1823  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  74.22 
 
 
224 aa  337  9e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000404138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2660  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  74.11 
 
 
219 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2992  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  70.62 
 
 
260 aa  293  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0958694  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3397  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  71.43 
 
 
234 aa  286  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1482  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  61.16 
 
 
224 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149014  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4174  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  61.16 
 
 
224 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00728249  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3482  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  59.26 
 
 
219 aa  266  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3677  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  61.01 
 
 
241 aa  259  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3680  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  56.73 
 
 
192 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340738  normal  0.343344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3233  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  58.17 
 
 
191 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471576  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6042  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component (dctQ subunit)  57.79 
 
 
188 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0220277  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3265  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  56.25 
 
 
195 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5227  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  58.17 
 
 
195 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5945  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  56.73 
 
 
195 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0274895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2114  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  56.12 
 
 
194 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.305015  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2261  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  56.12 
 
 
194 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0242  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  53.27 
 
 
213 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.42927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0911  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  52.11 
 
 
227 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202479  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2570  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  52.11 
 
 
227 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4121  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  43.93 
 
 
210 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1518  putative C4-dicarboxylate transport protein DctQ  30.57 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004049  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system small permease component  31.72 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2138  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.65 
 
 
180 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455407  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2292  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.65 
 
 
193 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.61649 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1445  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.7 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.361291  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0709  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  28.25 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0539  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  27.68 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2909  tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctQ component  26.77 
 
 
234 aa  72  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0544  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.98 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.557919  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0619  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.24 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355022  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1646  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.05 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0446  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.99 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000156898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3328  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.21 
 
 
186 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1725  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.77 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529876  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2210  C4-dicarboxylate transporter, putative  22.22 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5096  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.27 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1812  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.63 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.133229 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1427  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.96 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000465338  normal  0.728772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1415  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.96 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.622021  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2716  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  21.93 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00307588  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4704  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.17 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3135  C4-dicarboxylate transporter, putative  23.47 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2501  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.26 
 
 
214 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4629  C4-dicarboxylate transporter  27.27 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206116  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3318  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.67 
 
 
175 aa  56.2  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00300706  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1362  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.44 
 
 
214 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0803937  normal  0.0447503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4632  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  27.75 
 
 
624 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248929  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4296  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.35 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1833  putative TRAP transporter  27.23 
 
 
188 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.860518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5944  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.79 
 
 
171 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02559  hypothetical protein  22.78 
 
 
187 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52820  C4-dicarboxylate transporter  29.08 
 
 
212 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117665  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0330  TRAP transporter, DctQ-like membrane protein  41.94 
 
 
180 aa  53.1  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3051  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.5 
 
 
210 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153555  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0720  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.97 
 
 
151 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0957  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.04 
 
 
173 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.614161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4137  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.69 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000154832  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2122  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0479632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2950  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  21.62 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0521342  normal  0.0653246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2807  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  21.62 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1551  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  21.62 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.202687  normal  0.417908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2825  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  21.62 
 
 
218 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1068  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25 
 
 
177 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3835  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.82 
 
 
172 aa  48.9  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0823774  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2559  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.27 
 
 
152 aa  48.5  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000186717  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0408  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  21.39 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68280  dicarboxylate transporter  26.8 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.408841  normal  0.10811 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4967  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36.62 
 
 
183 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.0811524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5907  dicarboxylate transporter  26.8 
 
 
210 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0918  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.06 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103011  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3869  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.91 
 
 
171 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499764  normal  0.600837 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4858  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.14 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6142  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  27.16 
 
 
619 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0423  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.95 
 
 
155 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0316304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3271  TRAP-type C4-dicarboxylate transporter small and large permease  29.77 
 
 
619 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373435  normal  0.294977 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1318  C4-dicarboxylate transport system, small subunit  18.67 
 
 
150 aa  46.2  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000464953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03640  TRAP dicarboxylic acid transporter, small integral-membrane component, DctQ  26.92 
 
 
210 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4716  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.37 
 
 
164 aa  45.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.60201  normal  0.0226509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1289  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.45 
 
 
187 aa  45.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2514  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.56 
 
 
207 aa  45.1  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377652  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1723  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  24.19 
 
 
164 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0475394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0554  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  42.86 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.29193  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0752  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.69 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.417644  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2953  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34.86 
 
 
188 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1376  hypothetical protein  26.47 
 
 
173 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0271  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.67 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0386  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30 
 
 
168 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7435  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  33.7 
 
 
190 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808455  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2238  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.45 
 
 
167 aa  43.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0208  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  22.86 
 
 
165 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3763  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.55 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5331  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  50 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0129  putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component (dctQ subunit)  35.29 
 
 
181 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524832  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2756  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  27.05 
 
 
628 aa  42  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.95761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0343  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.89 
 
 
168 aa  41.6  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>