76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1545 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  100 
 
 
213 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  65.9 
 
 
209 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  52.51 
 
 
222 aa  228  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  52.23 
 
 
224 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  53.21 
 
 
219 aa  217  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  51.11 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  31.65 
 
 
203 aa  94.7  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  30.88 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  34.41 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  33.18 
 
 
215 aa  88.6  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  28.45 
 
 
222 aa  87.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  29.36 
 
 
229 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  30.95 
 
 
243 aa  85.1  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  30.6 
 
 
190 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  29.24 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  29.56 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  28.25 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  31.48 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  32.37 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  30.83 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  32.26 
 
 
190 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  31.97 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  29.63 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  28 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  30.12 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  28.3 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  26.51 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  30.62 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  28.64 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  30.14 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  31.82 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  24.77 
 
 
231 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  28.5 
 
 
227 aa  61.6  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  27.88 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  22.12 
 
 
181 aa  59.3  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  30.23 
 
 
282 aa  58.9  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  28.43 
 
 
223 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  22.12 
 
 
181 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  33.94 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  27.91 
 
 
373 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  23.66 
 
 
401 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  40.48 
 
 
285 aa  55.5  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  25.88 
 
 
291 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  21.9 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  33.33 
 
 
274 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  33.33 
 
 
274 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  27.83 
 
 
373 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  26.26 
 
 
373 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  24.77 
 
 
357 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  27.75 
 
 
359 aa  52.8  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  24.04 
 
 
239 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  24.04 
 
 
239 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  24.04 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  24.04 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  38.37 
 
 
284 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  38.37 
 
 
284 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  26.03 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  25.91 
 
 
272 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  27.14 
 
 
340 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  23.05 
 
 
263 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  24.56 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  29.03 
 
 
287 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  24.74 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  28.5 
 
 
361 aa  45.1  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  28.75 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  28.23 
 
 
287 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  35.62 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  23.12 
 
 
316 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  27.32 
 
 
275 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  25.88 
 
 
288 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  28.26 
 
 
274 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  26.25 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  27.78 
 
 
278 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  27.41 
 
 
270 aa  42  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  24.39 
 
 
286 aa  42  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  25.58 
 
 
297 aa  41.2  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>