More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1476 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 134 aa  271  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  97.22 
 
 		 134 aa  219  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  74.81 
 
 		 128 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  73.2 
 
 		 118 aa  157  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  70.21 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  56.25 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  65.26 
 
 		 122 aa  137  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  46.24 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  36.07 
 
 		 210 aa  87.8  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  45.16 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  36 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  33 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  37.14 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  34.19 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  34.4 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  37.4 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  40.66 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  35 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  31.43 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0122  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302975  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  39.45 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2038  30S ribosomal protein S6  33.82 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  31 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00746  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741883  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  34.95 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  33.61 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0136  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  39.6 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0118  SSU ribosomal protein S6P  37.23 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0125  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4787  30S ribosomal protein S6  35.94 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  34 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  41.05 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  34 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  37.29 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2589  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3793  ribosomal protein S6  35.94 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00794169  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4444  30S ribosomal protein S6  35.94 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4669  30S ribosomal protein S6  35.94 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0711098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5716  30S ribosomal protein S6  35.94 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.394601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4659  30S ribosomal protein S6  35.94 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4733  30S ribosomal protein S6  35.94 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.387811  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4751  30S ribosomal protein S6  35.94 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.502035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4809  30S ribosomal protein S6  35.94 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.16196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3813  30S ribosomal protein S6  35.94 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4671  30S ribosomal protein S6  35.94 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4761  30S ribosomal protein S6  35.94 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04067  30S ribosomal protein S6  35.94 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0415  30S ribosomal protein S6  34.86 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04029  hypothetical protein  35.94 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  30.65 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  30.65 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1640  30S ribosomal protein S6  36.7 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0507943  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0927  30S ribosomal protein S6  33.64 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0134622  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  34 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0923  ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46862  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  34 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3592  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  32.67 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  29 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  32.06 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1087  30S ribosomal protein S6  33.64 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000589418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  33.65 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2830  30S ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  30.08 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  33.61 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  30.65 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  40 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  34 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  34.13 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  34.82 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  34.13 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  34.13 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>