More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1465 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  100 
 
 		 334 aa  684    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  35.67 
 
 		 348 aa  172  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  34.84 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  34.84 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  35.48 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  34.41 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  34.3 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  28.98 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  27.41 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  27.41 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  25.2 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  30.64 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  30.13 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  27.92 
 
 		 331 aa  90.1  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  28.25 
 
 		 331 aa  89.7  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.82 
 
 		 402 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  31.88 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  29.07 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  28.94 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  30.62 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  29.23 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  27.34 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.04 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  29.3 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  32.54 
 
 		 444 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  35.33 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  28.69 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  27.66 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  32.68 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  25.86 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  28.76 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  25.14 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  24.47 
 
 		 381 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  26.94 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  22.94 
 
 		 368 aa  79.3  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  27.16 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  26.56 
 
 		 338 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  25.99 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.03 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  29.2 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  26.17 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  24.69 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  26.61 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  27 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  28.86 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1646  integrase family protein  27.15 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  25.78 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  25.87 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  28.05 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  26.91 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  29.91 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  26.79 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09270  tyrosine recombinase XerC subunit  25.86 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111586  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  31.82 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  29.41 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.24 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5294  integrase family protein  29.33 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  27.35 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  26.59 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  26.36 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  25.82 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.76 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  32.48 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  33.02 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  32.05 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  27.84 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  26.79 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  24.91 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.47 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  28.69 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.99 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.99 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.99 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  31.52 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.05 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  32.87 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  28.51 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  25.16 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  27.46 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  31.41 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  33.74 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  28.01 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  28.63 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  32.48 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  28.39 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  23.61 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  33.55 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  27.62 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  24.52 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.85 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  33.92 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  28.39 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  28.7 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  31.17 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>