More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1443 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1443  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  100 
 
 
207 aa  434  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2778  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  96.14 
 
 
207 aa  424  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0134218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0955  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  73.66 
 
 
207 aa  337  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000977838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0521  methyltransferase, putative  65.69 
 
 
209 aa  300  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0906024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3034  putative methyltransferase  65.52 
 
 
237 aa  295  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417573  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2892  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  60.89 
 
 
220 aa  261  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.503574  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2910  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  52.68 
 
 
215 aa  244  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0761  methyltransferase, putative  47.8 
 
 
232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.88261e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1577  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  37.91 
 
 
339 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39160  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32.07 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0303  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32.46 
 
 
306 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0119  hypothetical protein  34.29 
 
 
240 aa  115  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0118328  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1073  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32.63 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.214882  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2748  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.52 
 
 
220 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032972  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5326  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  31.28 
 
 
234 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0405  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  36.16 
 
 
253 aa  111  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1569  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  31.19 
 
 
213 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0334963  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24960  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  30.86 
 
 
254 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.274743  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0545  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.77 
 
 
237 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0893  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.51 
 
 
264 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3782  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  36.09 
 
 
319 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0521  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.12 
 
 
225 aa  107  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0859  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.03 
 
 
277 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5871  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32.37 
 
 
288 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3167  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32.97 
 
 
213 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221792  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0182  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  34.25 
 
 
275 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0173  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  34.25 
 
 
275 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0425  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  30.48 
 
 
217 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0162  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  34.25 
 
 
267 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408902  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7016  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.55 
 
 
239 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.774499  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3118  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.49 
 
 
260 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4841  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.95 
 
 
217 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4594  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.95 
 
 
217 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4431  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.95 
 
 
217 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4449  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.95 
 
 
217 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4833  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.95 
 
 
217 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4950  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.95 
 
 
217 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4816  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.95 
 
 
217 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3504  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  34.04 
 
 
317 aa  105  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000485637 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18760  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  34.46 
 
 
331 aa  105  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.404471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2517  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  35.11 
 
 
314 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0198  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32.58 
 
 
266 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2489  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.12 
 
 
238 aa  104  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.389638  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002447  tRNA(m7G46)-methyltransferase  36.05 
 
 
239 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.719754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3860  hypothetical protein  32 
 
 
246 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00355604  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0758  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  30.22 
 
 
256 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1026  hypothetical protein  30.98 
 
 
236 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.73 
 
 
313 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0366  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  34.25 
 
 
267 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.73 
 
 
349 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4811  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.41 
 
 
217 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3592  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32.22 
 
 
229 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010395  normal  0.13719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0454  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  31.22 
 
 
263 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3624  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  30.34 
 
 
241 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0606  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32 
 
 
268 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1220  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.77 
 
 
238 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000013255  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4530  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.35 
 
 
217 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3919  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32.77 
 
 
248 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0446  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32.81 
 
 
265 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0033  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.63 
 
 
237 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11630  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  39.84 
 
 
301 aa  102  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.353819 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3362  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.89 
 
 
217 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2676  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  34.78 
 
 
231 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0231  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.33 
 
 
238 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.840136 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0005  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  34.62 
 
 
239 aa  101  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0101638  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2167  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.03 
 
 
264 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2125  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32.17 
 
 
227 aa  101  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0743  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.03 
 
 
264 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2037  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.03 
 
 
264 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3237  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.33 
 
 
230 aa  101  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2576  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.03 
 
 
264 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3119  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.03 
 
 
265 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0596  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  30.35 
 
 
256 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.786902  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1532  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32.2 
 
 
231 aa  101  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.578287  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3056  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.03 
 
 
265 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4146  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  36.72 
 
 
244 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61707  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0458  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  36.77 
 
 
272 aa  100  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2905  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  30.87 
 
 
246 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542053  normal  0.839592 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00280  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  35.82 
 
 
254 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2936  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.12 
 
 
246 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0027  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  31.02 
 
 
255 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3406  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  31.46 
 
 
239 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2704  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.14 
 
 
262 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2699  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  34.44 
 
 
238 aa  99.8  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.249796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4050  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  31.08 
 
 
259 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244378  normal  0.090551 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2890  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  31.49 
 
 
260 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1181  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.77 
 
 
238 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000107367  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1252  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.77 
 
 
238 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2872  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32.26 
 
 
238 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03590  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  34.69 
 
 
239 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1182  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.77 
 
 
238 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000998768  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3052  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  34.44 
 
 
238 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00032414  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1091  methyltransferase, putative  29.44 
 
 
221 aa  99.4  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3038  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  34.44 
 
 
238 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00181852  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2850  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  30.68 
 
 
469 aa  99.4  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.444447  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0883  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  31.82 
 
 
239 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1130  methyltransferase, putative  30 
 
 
235 aa  99  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0069  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  31.25 
 
 
229 aa  99  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.662361  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3507  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.72 
 
 
245 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2227  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  30.46 
 
 
233 aa  99  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.128966  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>