More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1440 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1440  response regulator receiver protein  100 
 
 
219 aa  450  1e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1378  response regulator receiver domain-containing protein  79.82 
 
 
219 aa  367  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321431  normal  0.0110306 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0106  response regulator receiver  34.58 
 
 
218 aa  143  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0827  response regulator receiver domain-containing protein  28.37 
 
 
221 aa  116  2e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.914575  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2081  response regulator receiver  28.84 
 
 
224 aa  111  8e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
396 aa  92  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  3.64001e-05 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0868  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
650 aa  86.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.19 
 
 
953 aa  86.3  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03564e-11 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.26 
 
 
470 aa  85.1  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  34.48 
 
 
228 aa  84  1e-15  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  37.19 
 
 
391 aa  84.3  1e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2550  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
685 aa  84.7  1e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
209 aa  84.3  1e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1899  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.82 
 
 
616 aa  84.3  1e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.764058  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2500  two component Fis family transcriptional regulator  34.4 
 
 
476 aa  83.6  2e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45900  nitrogen regulation protein, sigma 54-dependent response regulator NtrC (NR(I))  36.94 
 
 
478 aa  84  2e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0893  diguanylate cyclase  31.61 
 
 
566 aa  83.2  2e-15  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4191  nitrogen regulation protein NR(I)  32.35 
 
 
470 aa  83.2  3e-15  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.500264  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0027  nitrogen regulation protein NR(I)  32.35 
 
 
470 aa  82.8  3e-15  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.307133  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0025  nitrogen regulation protein NR(I)  32.35 
 
 
470 aa  83.2  3e-15  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151443  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0016  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  33.04 
 
 
468 aa  82.8  3e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0855054  normal  0.786337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1358  two component LuxR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
220 aa  83.2  3e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110964  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  31.71 
 
 
229 aa  82.8  4e-15  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4883  nitrogen regulation protein NR(I)  34.78 
 
 
470 aa  82.4  5e-15  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.177074  hitchhiker  3.22182e-05 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  31.2 
 
 
226 aa  82.4  5e-15  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2541  nitrogen regulation protein NR(I)  38.74 
 
 
470 aa  82.4  5e-15  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0339  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  29.59 
 
 
478 aa  81.6  7e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2205  two component Fis family transcriptional regulator  30.97 
 
 
182 aa  81.6  7e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5101  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  29.59 
 
 
478 aa  81.6  8e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67680  two-component response regulator NtrC  35.14 
 
 
476 aa  81.6  8e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000437551  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0352  nitrogen regulation protein NR(I)  35.14 
 
 
478 aa  81.6  8e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4923  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  29.59 
 
 
478 aa  81.6  8e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.924842  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5048  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  29.59 
 
 
478 aa  81.6  8e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.05 
 
 
953 aa  81.6  8e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4822  helix-turn-helix, Fis-type:nitrogen regulation protein NR(I)  35.14 
 
 
478 aa  81.6  8e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0415  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  29.59 
 
 
478 aa  81.3  1e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.855382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.44 
 
 
223 aa  80.9  1e-14  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2371  response regulator receiver protein  27.45 
 
 
233 aa  80.9  1e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3269  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.91 
 
 
467 aa  81.3  1e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5859  two-component response regulator NtrC  35.14 
 
 
476 aa  81.3  1e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4159  nitrogen regulation protein NR(I)  34.78 
 
 
470 aa  80.9  1e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.086406  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3962  nitrogen regulation protein NR(I)  34.78 
 
 
470 aa  81.3  1e-14  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2715  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.24 
 
 
314 aa  81.3  1e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0976  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 
237 aa  80.1  2e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1261  nitrogen assimilation regulatory response regulator transcription regulator protein  37.27 
 
 
502 aa  80.1  2e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.634694  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4222  nitrogen regulation protein NR(I)  33.91 
 
 
470 aa  79.7  3e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.327829  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
653 aa  79.7  3e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4505  nitrogen regulation protein NR(I)  33.91 
 
 
470 aa  80.1  3e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  36.21 
 
 
248 aa  79.3  4e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1886  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.33 
 
 
461 aa  79.3  4e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1350  response regulator receiver protein  34.68 
 
 
147 aa  79  5e-14  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00189482  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4237  nitrogen regulation protein NR(I)  33.91 
 
 
469 aa  79  6e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5144  response regulator receiver protein  31.2 
 
 
150 aa  79  6e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495356  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4148  nitrogen regulation protein NR(I)  33.91 
 
 
469 aa  79  6e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4253  nitrogen regulation protein NR(I)  33.91 
 
 
472 aa  79  6e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.177692  normal  0.167125 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4216  nitrogen regulation protein NR(I)  33.91 
 
 
469 aa  79  6e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.295301  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4333  nitrogen regulation protein NR(I)  33.91 
 
 
469 aa  79  6e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4118  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  33.91 
 
 
469 aa  79  6e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  37.39 
 
 
248 aa  78.6  6e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4390  nitrogen regulation protein NR(I)  33.91 
 
 
469 aa  79  6e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.127215  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4394  nitrogen regulation protein NR(I)  33.91 
 
 
469 aa  79  6e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4344  nitrogen regulation protein NR(I)  33.91 
 
 
469 aa  79  6e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5314  nitrogen regulation protein NR(I)  33.91 
 
 
472 aa  79  6e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.111299  normal  0.738695 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00584  response regulator  34.15 
 
 
467 aa  79  6e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4287  nitrogen regulation protein NR(I)  33.91 
 
 
469 aa  79  6e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0756679  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2720  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
657 aa  79  6e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  38.18 
 
 
454 aa  78.6  7e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 
226 aa  78.6  7e-14  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2321  nitrogen regulation protein NR(I)  37.27 
 
 
468 aa  78.6  7e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03702  hypothetical protein  33.91 
 
 
469 aa  78.6  7e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4095  nitrogen regulation protein NR(I)  33.91 
 
 
469 aa  78.6  7e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03753  fused DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with GlnL: response regulator/sigma54 interaction protein  33.91 
 
 
469 aa  78.6  7e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4098  nitrogen regulation protein NR(I)  34.78 
 
 
470 aa  78.2  8e-14  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4153  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.11 
 
 
466 aa  78.2  9e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  34.68 
 
 
226 aa  77.8  1e-13  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  34.35 
 
 
534 aa  77.8  1e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4144  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  35.14 
 
 
477 aa  78.2  1e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2343  two component transcriptional regulator, Fis family  31.72 
 
 
185 aa  77.8  1e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.888574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2255  two component transcriptional regulator, Fis family  31.72 
 
 
185 aa  77.8  1e-13  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0449716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1182  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  36.36 
 
 
502 aa  77.8  1e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135546  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1525  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.52 
 
 
316 aa  78.2  1e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15223e-23 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1089  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  36.36 
 
 
502 aa  77.8  1e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1992  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.33 
 
 
460 aa  77.4  1e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1607  two component Fis family transcriptional regulator  31.72 
 
 
185 aa  77.8  1e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.016434  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  35.14 
 
 
457 aa  77.4  2e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2054  helix-turn-helix, Fis-type:nitrogen regulation protein NR(I)  37.27 
 
 
524 aa  77  2e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001908  nitrogen regulation protein NR(I)  35.45 
 
 
467 aa  77  2e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0410  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 
238 aa  77.4  2e-13  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.51 
 
 
347 aa  77  2e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0224  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
379 aa  77.4  2e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.62 
 
 
225 aa  77.4  2e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  6.52561e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3217  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  30.41 
 
 
501 aa  77.4  2e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
517 aa  77  2e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.19 
 
 
347 aa  77.4  2e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  41.35 
 
 
243 aa  77.4  2e-13  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2059  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  35.45 
 
 
528 aa  76.6  3e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0914415  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  29.91 
 
 
121 aa  76.6  3e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>