142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1438 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1438  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
220 aa  440  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.44353 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1380  DSBA oxidoreductase  94.52 
 
 
221 aa  418  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172007  normal  0.0174557 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0002  integrase/recombinase  60.83 
 
 
218 aa  258  7e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000442871  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1147  thiol:disulfide interchange protein DsbA  60 
 
 
219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3451  disulfide isomerase  59.45 
 
 
223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3546  disulfide isomerase  59.45 
 
 
223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.504028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3444  disulfide isomerase  59.45 
 
 
223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.923354  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3374  disulfide isomerase  59.45 
 
 
223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3379  disulfide isomerase  59.45 
 
 
223 aa  251  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.996727 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3334  DsbA family thioredoxin  59.45 
 
 
222 aa  249  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0433  disulfide isomerase  54.02 
 
 
228 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.529354  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2110  hypothetical protein  46.7 
 
 
213 aa  185  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0856  disulfide isomerase  46.05 
 
 
219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3871  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  39.25 
 
 
203 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0951  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.99 
 
 
220 aa  141  6e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.99 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.325546  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  37.62 
 
 
202 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4028  DSBA oxidoreductase  38.25 
 
 
203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1013  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.7 
 
 
220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000248495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4023  DSBA oxidoreductase  37.33 
 
 
203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0559  thiol:disulfide interchange protein, DsbA family  33.64 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1665  disulfide isomerase  30.67 
 
 
223 aa  105  7e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3999  putative disulfide isomerase  32.77 
 
 
200 aa  101  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.136528 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1021  putative thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.14 
 
 
223 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00252175  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0954  thiol:disulfide interchange protein DsbA, putative  29.67 
 
 
223 aa  95.5  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0883  thiol:disulfide interchange protein DsbA, putative  29.5 
 
 
223 aa  95.5  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30 
 
 
202 aa  82  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.96 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 
202 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 
202 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 
202 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 
202 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  29.47 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 
203 aa  72  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  27.37 
 
 
203 aa  72  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.44 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.99 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  24.17 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  24.17 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.48 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  23.7 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.25 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  23.7 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  27.57 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.6 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  27.54 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.92 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  24.55 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  23.18 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  27.91 
 
 
200 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  24.09 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
206 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
206 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.81 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
206 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
206 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.1 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  24.42 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.63 
 
 
207 aa  59.7  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.12 
 
 
207 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 
207 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 
207 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  25 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  27.01 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  25 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  25 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  26.09 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  25 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.53 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  25 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.17 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  26.13 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  23.88 
 
 
216 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  23.41 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.51 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.51 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.51 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  24.37 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.99 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  21.46 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.67 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  25.67 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.67 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.67 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  25.67 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.67 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.67 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.67 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.67 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  23.15 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>