223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1423 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
180 aa  370  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  69.82 
 
 
338 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  67.84 
 
 
335 aa  246  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  61.76 
 
 
340 aa  223  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  54.07 
 
 
334 aa  190  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  51.46 
 
 
335 aa  189  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  52.66 
 
 
325 aa  186  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  55.36 
 
 
326 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  56.73 
 
 
323 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  49.42 
 
 
320 aa  184  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  51.48 
 
 
295 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  51.16 
 
 
333 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  49.42 
 
 
327 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  53.49 
 
 
321 aa  181  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  49.41 
 
 
325 aa  181  7e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  51.48 
 
 
323 aa  180  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  50 
 
 
319 aa  179  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  49.42 
 
 
321 aa  178  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  50.89 
 
 
336 aa  177  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  50.99 
 
 
323 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
506 aa  176  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  50 
 
 
321 aa  176  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  47.09 
 
 
324 aa  174  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  48.24 
 
 
321 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  47.67 
 
 
324 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  50 
 
 
321 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  48.84 
 
 
321 aa  170  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  48.84 
 
 
321 aa  170  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  48.84 
 
 
327 aa  170  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  48.84 
 
 
321 aa  170  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  47.22 
 
 
321 aa  168  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  47.22 
 
 
321 aa  168  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  52.03 
 
 
160 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  47.67 
 
 
321 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  48.82 
 
 
321 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  46.2 
 
 
325 aa  159  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  47.06 
 
 
316 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  62.38 
 
 
101 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  40.94 
 
 
321 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  40.59 
 
 
312 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  38.82 
 
 
316 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  40 
 
 
314 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  41.95 
 
 
319 aa  134  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  46.58 
 
 
312 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  41.04 
 
 
313 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  40.46 
 
 
326 aa  129  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  40.59 
 
 
316 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  48.8 
 
 
288 aa  125  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  40.35 
 
 
282 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  40.59 
 
 
318 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  39.39 
 
 
251 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  44.22 
 
 
315 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  42.47 
 
 
289 aa  121  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  39.77 
 
 
305 aa  121  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  40.48 
 
 
277 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  38.33 
 
 
289 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  35.44 
 
 
258 aa  115  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  41.26 
 
 
323 aa  114  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  39.05 
 
 
288 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  39.64 
 
 
288 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  43.08 
 
 
241 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  38.93 
 
 
287 aa  112  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  39.61 
 
 
322 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  38.46 
 
 
288 aa  111  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  47.62 
 
 
112 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  36.31 
 
 
321 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  37.12 
 
 
253 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  37.12 
 
 
253 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  39.29 
 
 
316 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  35 
 
 
336 aa  103  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  41.79 
 
 
230 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  34.72 
 
 
250 aa  102  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  37.04 
 
 
230 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  37.04 
 
 
230 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  37.65 
 
 
230 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  37.16 
 
 
287 aa  101  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  40.83 
 
 
241 aa  100  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  39.74 
 
 
233 aa  99.4  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  47.25 
 
 
101 aa  99  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  36.18 
 
 
310 aa  98.6  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  39.61 
 
 
255 aa  97.1  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  36 
 
 
234 aa  96.3  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  38.52 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  37.06 
 
 
235 aa  95.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  37.78 
 
 
236 aa  95.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  37.58 
 
 
216 aa  94.4  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 
252 aa  94.4  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  40.6 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  34.33 
 
 
236 aa  93.6  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  36.36 
 
 
231 aa  92.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  34.33 
 
 
236 aa  92.8  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  36.84 
 
 
234 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  38.57 
 
 
304 aa  92  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  31.77 
 
 
224 aa  91.7  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  39.19 
 
 
232 aa  91.3  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  90.5  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  90.5  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  41.22 
 
 
234 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  37.59 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  34.93 
 
 
221 aa  89.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>