27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1416 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  100 
 
 		 154 aa  310  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  64.9 
 
 		 153 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  61.18 
 
 		 363 aa  192  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0478  hypothetical protein  59.6 
 
 		 152 aa  189  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  33.79 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  32.14 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  32.24 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  29.93 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  28.99 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  30.46 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  23.29 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  27.7 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  28 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  24.43 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  27.7 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  27.21 
 
 		 1005 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  27.7 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  24.6 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  26.52 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  28.87 
 
 		 185 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  29.8 
 
 		 994 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  26.87 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1314  hypothetical protein  26.11 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.174382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2291  rubrerythrin  22.76 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.683509  normal  0.317377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0745  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  29.14 
 
 		 994 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375637  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2337  hypothetical protein  32.84 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  30.65 
 
 		 284 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>