More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1409 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  69.15 
 
 		 456 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  97.1 
 
 		 449 aa  895    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  100 
 
 		 449 aa  917    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  68.71 
 
 		 456 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  66.15 
 
 		 456 aa  634    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  77.73 
 
 		 449 aa  745    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  67.4 
 
 		 458 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  64.25 
 
 		 456 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  55.35 
 
 		 448 aa  503  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  54.09 
 
 		 440 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  52.71 
 
 		 453 aa  485  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  52.71 
 
 		 453 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  52.71 
 
 		 453 aa  485  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  52.71 
 
 		 453 aa  485  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  52.49 
 
 		 449 aa  485  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  52.71 
 
 		 453 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  52.71 
 
 		 453 aa  485  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  52.71 
 
 		 453 aa  485  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  53.85 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  52.49 
 
 		 453 aa  485  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  54.13 
 
 		 445 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  51.82 
 
 		 453 aa  479  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  51.71 
 
 		 441 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  53.3 
 
 		 465 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  52.27 
 
 		 444 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  52.34 
 
 		 454 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  52.48 
 
 		 446 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  51.59 
 
 		 481 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  53.29 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  51.67 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  51.13 
 
 		 444 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  51.82 
 
 		 442 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  52.8 
 
 		 463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  51.35 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  49.77 
 
 		 481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  52.03 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  48.99 
 
 		 442 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  52.35 
 
 		 463 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  51.24 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  48.52 
 
 		 453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  52.48 
 
 		 470 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  50.8 
 
 		 460 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  51.47 
 
 		 471 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  51.69 
 
 		 471 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  50.22 
 
 		 462 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  49.32 
 
 		 461 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  51.47 
 
 		 471 aa  438  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  51.47 
 
 		 471 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  50.23 
 
 		 471 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  49.89 
 
 		 471 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  51.47 
 
 		 471 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  51.47 
 
 		 471 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  50.23 
 
 		 471 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  51.47 
 
 		 471 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  51.47 
 
 		 471 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  50.22 
 
 		 462 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  51.47 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  48.31 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  50.56 
 
 		 473 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  51.25 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  50.9 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  50.89 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  50.11 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  50.22 
 
 		 462 aa  435  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  48.4 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  51.25 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  50.9 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  50.79 
 
 		 470 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  48.63 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 468 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  49.89 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  50.79 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 468 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  50.56 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  48.76 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  48.99 
 
 		 460 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  50.56 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  49.89 
 
 		 463 aa  431  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  50.56 
 
 		 468 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  50.45 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  50.45 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  50.56 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  50.56 
 
 		 468 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  50.56 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  49.89 
 
 		 468 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  51 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  51.12 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  50.79 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  49.89 
 
 		 464 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  49.32 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  50.56 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  49.89 
 
 		 474 aa  428  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  49.66 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 460 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  50.56 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  50.56 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  47.17 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  50.57 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  48.54 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>