More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1356 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  94.81 
 
 		 154 aa  298  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  51.01 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  48.32 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  45.21 
 
 		 158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 		 167 aa  107  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  37.16 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  37.93 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  37.93 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  37.24 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  37.16 
 
 		 167 aa  98.6  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  37.16 
 
 		 167 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 		 157 aa  97.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  36.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  36.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  97.1  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  97.1  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  97.1  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  34.21 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  36 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  35.53 
 
 		 168 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  35.53 
 
 		 168 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  35.53 
 
 		 168 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  35.53 
 
 		 168 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  35.53 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  35.53 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1629  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00470119 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  35.53 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  35.53 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  35.53 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  35.14 
 
 		 167 aa  93.6  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  35.86 
 
 		 164 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  35.86 
 
 		 164 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  36.49 
 
 		 161 aa  93.6  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  35.86 
 
 		 164 aa  93.6  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 162 aa  93.6  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02115  leucine-responsive transcriptional regulator  37.23 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000100067  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0399  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  37.93 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 157 aa  92  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  35.81 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 167 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  38 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  38 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  37.24 
 
 		 162 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 162 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2760  leucine-responsive transcriptional regulator  35.17 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 164 aa  90.5  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 162 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  37.24 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.24 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 177 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2419  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  0.408785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1428  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  35.86 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  35.81 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  35.81 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  35.81 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 166 aa  87.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>