More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1341 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
321 aa  627  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  91.69 
 
 
325 aa  545  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  52.41 
 
 
308 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.18 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2881  hypothetical protein  89.89 
 
 
162 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  35.54 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.53 
 
 
318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  32.28 
 
 
314 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  33.22 
 
 
306 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  29.43 
 
 
315 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.69 
 
 
306 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.77 
 
 
282 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  32.45 
 
 
311 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  35.02 
 
 
296 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  34.1 
 
 
299 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  33.19 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.27 
 
 
317 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.27 
 
 
313 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  28.53 
 
 
317 aa  89  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  28.38 
 
 
347 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  28 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  31.51 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  32.8 
 
 
316 aa  85.9  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  31.88 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  32.64 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.8 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  29.58 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  30.04 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  30.42 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2994  hypothetical protein  30.17 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263501  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  28.17 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.26 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  30.43 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  28.62 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  31 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  27.11 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  27.96 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  28.37 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  27.83 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.69 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.7 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.93 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.28 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.82 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  29 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  25.61 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.65 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  24.12 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.3 
 
 
315 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.95 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.95 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.95 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  24.05 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  26.64 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  25.71 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  26.19 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  25.78 
 
 
292 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.31 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 
299 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.97 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.53 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  25.08 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.86 
 
 
303 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 
297 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  29.02 
 
 
281 aa  63.5  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  26.86 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  26.53 
 
 
294 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  26.53 
 
 
294 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  26.05 
 
 
298 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  23.88 
 
 
311 aa  62.4  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  23.55 
 
 
296 aa  62.4  0.000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  24.64 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  26.5 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.5 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.79 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  27.97 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  24.64 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  26.5 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  26.5 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  26.5 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.48 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.09 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  26.62 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.36 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  25.45 
 
 
291 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  25.48 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  22.86 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>