More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1241 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3009  amidohydrolase  93.72 
 
 		 414 aa  795    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1241  amidohydrolase  100 
 
 		 414 aa  843    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29686e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2081  amidohydrolase  56.59 
 
 		 415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515321  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1645  Atz/Trz family chlorohydrolase  55.1 
 
 		 421 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1708  Atz/Trz family chlorohydrolase  55.34 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0266273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3409  amidohydrolase  48.29 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00196752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0961  amidohydrolase  47.74 
 
 		 413 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  40.16 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3087  amidohydrolase  31.03 
 
 		 424 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000127453 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2239  S-adenosylhomocysteine deaminase  32.62 
 
 		 392 aa  159  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8785  amidohydrolase  33.73 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.988159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8056  amidohydrolase  30.5 
 
 		 428 aa  156  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0252  amidohydrolase  32.98 
 
 		 368 aa  146  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  29.93 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  28.54 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1825  amidohydrolase  32.58 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.629302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1275  amidohydrolase  30.21 
 
 		 399 aa  139  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0024  amidohydrolase  32.52 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  30.79 
 
 		 663 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.98 
 
 		 484 aa  136  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.98 
 
 		 451 aa  136  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1971  amidohydrolase  30.9 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  34.2 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3845  amidohydrolase  31.2 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  29.85 
 
 		 428 aa  132  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.7 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  28.83 
 
 		 660 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0576  amidohydrolase  33.54 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  29.11 
 
 		 656 aa  130  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  31.55 
 
 		 434 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.18 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  30.53 
 
 		 663 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  26.39 
 
 		 462 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2963  amidohydrolase family protein  29.73 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  32.04 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0465  amidohydrolase  30.89 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.742317  normal  0.0452938 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  27.44 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1743  S-adenosylhomocysteine deaminase  31.27 
 
 		 373 aa  127  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  28.83 
 
 		 422 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.83 
 
 		 452 aa  126  8.000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  29.19 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  28.97 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  30.81 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.85 
 
 		 444 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  31.36 
 
 		 440 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  27.11 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  30.7 
 
 		 451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.25 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.63 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0873  cytosine deaminase  28.19 
 
 		 457 aa  121  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.291965  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  27.46 
 
 		 422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.61 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  27.53 
 
 		 422 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.19 
 
 		 441 aa  119  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  27.86 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.85 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1846  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.62 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  28.98 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  31.59 
 
 		 442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  30.02 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  30.02 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0686  chlorohydrolase  26.61 
 
 		 408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.777216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  29.05 
 
 		 431 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0398  amidohydrolase  34.66 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  29.02 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  28 
 
 		 428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0399  amidohydrolase  33.69 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.408969  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1424  amidohydrolase  40.45 
 
 		 478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.76 
 
 		 453 aa  113  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2149  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.77 
 
 		 446 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.450112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  29.03 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  27.09 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4080  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.07 
 
 		 444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.55583  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  28.42 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15770  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.24 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.48 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  29.05 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0289  amidohydrolase  27.27 
 
 		 408 aa  110  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1707  amidohydrolase  30.08 
 
 		 431 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000668627  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  26.7 
 
 		 469 aa  110  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1029  amidohydrolase  31.19 
 
 		 438 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.4 
 
 		 458 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1575  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.79 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  28.19 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1632  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.79 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3188  amidohydrolase  30.33 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  26.67 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0370  amidohydrolase 1  33.74 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  30 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  29.64 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.78 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.43 
 
 		 432 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2541  amidohydrolase  27.47 
 
 		 457 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448318  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.64 
 
 		 441 aa  106  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2741  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.71 
 
 		 447 aa  106  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.05 
 
 		 457 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.62 
 
 		 434 aa  106  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.05 
 
 		 465 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  27.6 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.05 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>