113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1197 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  35.91 
 
 		 1779 aa  692    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  80.51 
 
 		 3244 aa  3118    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  100 
 
 		 2079 aa  4005    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  34.62 
 
 		 3544 aa  490  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.51 
 
 		 3699 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  34.9 
 
 		 3699 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  36.64 
 
 		 2853 aa  338  7e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  28.72 
 
 		 2402 aa  332  6e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  35.48 
 
 		 2820 aa  328  8.000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  33.37 
 
 		 4231 aa  326  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.66 
 
 		 11716 aa  278  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  28.75 
 
 		 4465 aa  212  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  31.57 
 
 		 2636 aa  205  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  29.59 
 
 		 3563 aa  182  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  26.23 
 
 		 3474 aa  169  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  25.26 
 
 		 9867 aa  166  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  33.41 
 
 		 2522 aa  154  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.42 
 
 		 5787 aa  152  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  30.2 
 
 		 3598 aa  141  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  56.8 
 
 		 672 aa  131  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  29.18 
 
 		 1631 aa  112  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  38.44 
 
 		 2001 aa  111  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.23 
 
 		 1884 aa  103  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  27.31 
 
 		 1867 aa  104  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  48.33 
 
 		 788 aa  102  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  51.67 
 
 		 753 aa  100  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  31.83 
 
 		 1672 aa  99.8  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  31.43 
 
 		 683 aa  98.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  35.08 
 
 		 731 aa  92  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.8 
 
 		 887 aa  90.5  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  41.75 
 
 		 494 aa  89.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  25.16 
 
 		 2839 aa  87.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  48.5 
 
 		 1148 aa  87  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  25.23 
 
 		 2890 aa  84.7  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  31.34 
 
 		 2503 aa  84.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.51 
 
 		 1673 aa  84.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  27.58 
 
 		 2656 aa  83.2  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  60.71 
 
 		 962 aa  81.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  27.01 
 
 		 3927 aa  80.1  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  56.31 
 
 		 622 aa  79.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  23.84 
 
 		 2074 aa  77  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  26.72 
 
 		 2233 aa  75.9  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  31.22 
 
 		 1222 aa  75.9  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  31.86 
 
 		 2476 aa  74.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  31.74 
 
 		 1232 aa  74.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  51.79 
 
 		 884 aa  73.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1879 aa  72.8  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  57.32 
 
 		 824 aa  72.4  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  44.86 
 
 		 840 aa  71.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  28.57 
 
 		 3542 aa  71.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  59.3 
 
 		 1016 aa  71.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.65 
 
 		 815 aa  70.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  35.14 
 
 		 2506 aa  69.7  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.96 
 
 		 933 aa  69.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  28.66 
 
 		 1544 aa  68.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0728  putative Ig  27.74 
 
 		 1126 aa  67  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.218703  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  27.19 
 
 		 1428 aa  63.2  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  29.15 
 
 		 5020 aa  62  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  31.95 
 
 		 3911 aa  62  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0859  hypothetical protein  21.99 
 
 		 668 aa  59.7  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.197444  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  28.04 
 
 		 2153 aa  59.7  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.16 
 
 		 674 aa  59.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.69 
 
 		 1092 aa  58.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  30.52 
 
 		 2831 aa  58.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3852  hypothetical protein  26.57 
 
 		 989 aa  57.4  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000234883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  44.26 
 
 		 726 aa  57.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.16 
 
 		 1072 aa  57  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  64.29 
 
 		 710 aa  56.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  40.85 
 
 		 688 aa  56.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  30.13 
 
 		 1421 aa  55.8  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  31.47 
 
 		 797 aa  55.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.29 
 
 		 994 aa  55.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  37.21 
 
 		 2132 aa  55.5  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2281  serine threonine rich antigen  33.33 
 
 		 1870 aa  55.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  27.17 
 
 		 1011 aa  54.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  26.8 
 
 		 8321 aa  53.9  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0929  Ig family protein  31.62 
 
 		 1025 aa  53.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1002 aa  53.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  30.67 
 
 		 1081 aa  53.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.62 
 
 		 2507 aa  52.8  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  39.02 
 
 		 868 aa  52.4  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  35.58 
 
 		 5769 aa  51.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  27.84 
 
 		 1134 aa  51.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  34.12 
 
 		 868 aa  50.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  33.68 
 
 		 868 aa  50.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  27.61 
 
 		 1323 aa  50.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  35.26 
 
 		 1338 aa  50.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0022  fibronectin type III domain-containing protein  24.6 
 
 		 730 aa  50.1  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0168573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1022 aa  49.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  29.67 
 
 		 3089 aa  49.7  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.98 
 
 		 692 aa  49.3  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.09 
 
 		 1321 aa  49.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1125  hypothetical protein  33.73 
 
 		 657 aa  48.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.837381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1126  hypothetical protein  33.73 
 
 		 657 aa  48.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0152  PKD  28.47 
 
 		 506 aa  48.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000535415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  30.43 
 
 		 1215 aa  48.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  30.43 
 
 		 1215 aa  48.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  26.4 
 
 		 909 aa  48.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  23.57 
 
 		 4848 aa  48.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  30.48 
 
 		 2961 aa  47.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>