120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1149 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
154 aa  310  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  97.4 
 
 
154 aa  302  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  43.23 
 
 
156 aa  141  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  46.45 
 
 
160 aa  138  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  44.76 
 
 
156 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  41.56 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.67 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  34.01 
 
 
164 aa  94  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.36 
 
 
159 aa  94  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  36.55 
 
 
166 aa  93.6  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.57 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  39.06 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  32.48 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.94 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  30.97 
 
 
168 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  30.3 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.92 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.97 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.34 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  36.05 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  30 
 
 
173 aa  72  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.74 
 
 
178 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  33.33 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  32.19 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  32.19 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  32.19 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  31.01 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  32.19 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  31.51 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  32.19 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  31.51 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  32.19 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.55 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  31.9 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.31 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  31.51 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  32.65 
 
 
187 aa  67  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  32.19 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  28.38 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  28.38 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.24 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  33.11 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.37 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.7 
 
 
181 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  25 
 
 
177 aa  61.2  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0524  phosphodiesterase  32.26 
 
 
182 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0250808  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  27.48 
 
 
169 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  32.08 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  31.85 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  31.85 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  33.97 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  30.87 
 
 
181 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  32.61 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  31.68 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  28.49 
 
 
219 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.45 
 
 
162 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  30.53 
 
 
168 aa  53.9  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  25.97 
 
 
196 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  28.19 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  30.3 
 
 
174 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.82 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.89 
 
 
165 aa  51.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  25 
 
 
180 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.94 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  30.67 
 
 
188 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  32.34 
 
 
168 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.06 
 
 
175 aa  50.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.59 
 
 
172 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  25 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  30 
 
 
179 aa  48.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  28.47 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  32.57 
 
 
175 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  33.58 
 
 
154 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  30 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  27.97 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.58 
 
 
196 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.01 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.06 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  30.22 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  27.78 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  31.25 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  27.78 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  29.17 
 
 
176 aa  44.7  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.44 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.08 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  30.22 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3228  hypothetical protein  30.77 
 
 
219 aa  44.3  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00856854  normal  0.0495142 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  25.32 
 
 
178 aa  43.9  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.68 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0682  metallophosphoesterase  31.52 
 
 
217 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0388677  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  29.88 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  30.49 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4430  hypothetical protein  30.53 
 
 
246 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  26.92 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  29.56 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  27.78 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  26.17 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1957  phosphodiesterase  31.63 
 
 
240 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  26.97 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  24.88 
 
 
254 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>