142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1128 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1128  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 
55 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3134  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  96.36 
 
 
55 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1948  twin arginine-targeting protein translocase  70.91 
 
 
55 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  66.67 
 
 
57 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  59.26 
 
 
56 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  60 
 
 
59 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  55.36 
 
 
60 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1959  twin arginine translocase protein A  61.82 
 
 
57 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2263  twin arginine translocase protein A  61.82 
 
 
57 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  51.85 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.44 
 
 
55 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.98 
 
 
64 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1290  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.44 
 
 
57 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1046  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.44 
 
 
59 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00953669 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  49.12 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  45.83 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  53.66 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.67 
 
 
58 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  52.38 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  52.38 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.67 
 
 
58 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.45 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.62 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3049  twin arginine translocase protein A  63.27 
 
 
65 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  52.27 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.51 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  45.24 
 
 
76 aa  50.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  47.62 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  45.24 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.81 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  43.18 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.81 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  43.18 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  38.98 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0289  twin arginine translocase protein A  49.09 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1896  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  42.86 
 
 
83 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.81 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  40.48 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  43.18 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03291  hypothetical protein  40.48 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1201  twin arginine translocase protein A  61.22 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10686  Tat family transporter: pH-dependent thylakoid protein export into thylakoid  42.86 
 
 
55 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  45 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1815  twin-arginine translocation protein TatA/E  46.43 
 
 
56 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2839  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 
55 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.4 
 
 
87 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  45.83 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  45.83 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  45.83 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  45.83 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  45.83 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  41.07 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.65 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  40 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3190  twin arginine-targeting protein translocase  47.27 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1278  Sec-independent protein translocase TatA  53.33 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0109777  hitchhiker  0.00000252177 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1174  twin arginine translocase protein A  35.85 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000428272  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1117  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.46 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0148  twin arginine translocase protein A  50.91 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  37.74 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  37.74 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  37.74 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  37.74 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  37.74 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  40.35 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  37.74 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  37.74 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2956  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1856  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000816668  normal  0.827039 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3028  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368135  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.86 
 
 
62 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  37.74 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0132  twin arginine translocase protein A  50.91 
 
 
63 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3167  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000551363  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  37.74 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2999  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
82 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3217  twin-arginine translocation protein TatA/E  47.27 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.6697199999999997e-20  hitchhiker  0.000106815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2379  twin arginine-targeting protein translocase  44.64 
 
 
55 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329124  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  39.68 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  44.19 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  44.19 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  42.55 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.55 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3157  twin arginine translocase protein A  33.96 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000988339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  42.55 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  42.55 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  42.55 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0251  twin arginine-targeting protein translocase  41.67 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.293668 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0045  twin arginine translocase protein A  45 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.895264  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4849  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.82 
 
 
56 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00272525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>