More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1061 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  100 
 
 
343 aa  691    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  91.76 
 
 
342 aa  615  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  57.99 
 
 
346 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  56.36 
 
 
351 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  56.6 
 
 
342 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  49.84 
 
 
352 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  43.73 
 
 
341 aa  275  7e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  39.75 
 
 
338 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  42.53 
 
 
374 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  40.9 
 
 
362 aa  263  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  37.07 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  37.81 
 
 
354 aa  249  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  43.55 
 
 
345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  40.52 
 
 
359 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  38.02 
 
 
341 aa  235  8e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  32.36 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  32.07 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  38.11 
 
 
359 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  34.67 
 
 
314 aa  192  9e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  35.48 
 
 
354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  37.46 
 
 
344 aa  175  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  34.91 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  36.33 
 
 
317 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  35.94 
 
 
317 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  37.67 
 
 
401 aa  169  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  36.7 
 
 
401 aa  169  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  37.97 
 
 
340 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.04 
 
 
309 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  32.61 
 
 
483 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
469 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  33.46 
 
 
477 aa  110  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  27.49 
 
 
527 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  31.97 
 
 
514 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  31.73 
 
 
510 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  42.96 
 
 
512 aa  102  9e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  30.08 
 
 
522 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  31.09 
 
 
526 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  33.19 
 
 
530 aa  99.4  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  36.36 
 
 
520 aa  98.6  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  30.9 
 
 
459 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  30.04 
 
 
459 aa  97.1  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  30.04 
 
 
459 aa  96.7  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.23 
 
 
473 aa  93.6  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  32.97 
 
 
526 aa  90.9  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  29.08 
 
 
548 aa  90.1  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  33.59 
 
 
563 aa  87.8  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  33.59 
 
 
541 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  35.39 
 
 
547 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  33.59 
 
 
541 aa  87  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  27.35 
 
 
541 aa  86.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  30.45 
 
 
555 aa  85.9  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  26.94 
 
 
541 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  28.78 
 
 
558 aa  84.7  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  29.27 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  27.07 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  28.15 
 
 
574 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3422  putative radical SAM protein  28.19 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  26.32 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.6 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  28.93 
 
 
556 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  26.32 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  26.39 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  27.16 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  23.98 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  26.67 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  26.91 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0944  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.62 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  27.53 
 
 
598 aa  80.9  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  26.91 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  31.06 
 
 
553 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07700  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.13 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  25.94 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4499  Fe-S oxidoreductase  27.75 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  26.07 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  25.23 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  25.23 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0528  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1320  hypothetical protein  24.89 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  29.91 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543862  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  27.41 
 
 
544 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4861  conserved hypothetical protein TIGR01212  27.31 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0376  hypothetical protein TIGR01212  27.31 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4579  putative radical SAM protein  27.31 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  22.73 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4646  hypothetical protein  27.31 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4885  conserved hypothetical protein TIGR01212  27.31 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  27.82 
 
 
557 aa  77.8  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5001  hypothetical protein  27.31 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  27.93 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  30.16 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0858  hypothetical protein  28.83 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4481  Fe-S oxidoreductase  27.31 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0165  hypothetical protein  29.57 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.375388  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  24.77 
 
 
309 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4871  conserved hypothetical protein TIGR01212  26.87 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  30.66 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  30.43 
 
 
316 aa  77  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.32 
 
 
585 aa  76.6  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  27.95 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  24.77 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>