More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1035 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
661 aa  1362    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  64.95 
 
 
671 aa  904    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  61.18 
 
 
663 aa  832    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  63.99 
 
 
661 aa  917    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  67.88 
 
 
661 aa  937    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  60.27 
 
 
662 aa  818    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  59.97 
 
 
662 aa  815    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  94.55 
 
 
661 aa  1295    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  67.27 
 
 
661 aa  944    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2517  hypothetical protein  60 
 
 
662 aa  829    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  66.41 
 
 
714 aa  897    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  65.96 
 
 
722 aa  890    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.44 
 
 
699 aa  520  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.89 
 
 
694 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.76 
 
 
694 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.67 
 
 
686 aa  471  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  38.22 
 
 
727 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.58 
 
 
713 aa  461  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  37.72 
 
 
730 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0698  putative iron-sulfur-binding reductase  37.81 
 
 
714 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0314835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  35.82 
 
 
752 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  38.16 
 
 
678 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.92 
 
 
683 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  36.65 
 
 
658 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  36.1 
 
 
659 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  38.66 
 
 
655 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.95 
 
 
656 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.65 
 
 
656 aa  392  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  36.32 
 
 
661 aa  392  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.82 
 
 
698 aa  389  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  36.91 
 
 
661 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  33.14 
 
 
703 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  33.33 
 
 
703 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  33.14 
 
 
703 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  33.14 
 
 
703 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.1 
 
 
699 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.81 
 
 
655 aa  382  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  33 
 
 
703 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  33 
 
 
703 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  33 
 
 
703 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  36.42 
 
 
720 aa  379  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  33.33 
 
 
703 aa  379  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  33 
 
 
703 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  32.96 
 
 
703 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5959  hypothetical protein  35.19 
 
 
720 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0717248 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  36.86 
 
 
678 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  34.88 
 
 
652 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.25 
 
 
664 aa  379  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0971  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.03 
 
 
723 aa  372  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.65 
 
 
663 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.15 
 
 
658 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  34.48 
 
 
683 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.35 
 
 
664 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.51 
 
 
658 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.04 
 
 
663 aa  365  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  35.42 
 
 
711 aa  364  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.42 
 
 
711 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  33.97 
 
 
629 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.98 
 
 
679 aa  362  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.27 
 
 
711 aa  359  8e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3824  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.24 
 
 
728 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.676113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  33.1 
 
 
739 aa  353  5e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  34.33 
 
 
743 aa  349  9e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0933  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.85 
 
 
695 aa  346  6e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271519  normal  0.676616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  33.24 
 
 
716 aa  345  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1707  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.19 
 
 
737 aa  345  2e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121804  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  33.66 
 
 
732 aa  343  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  32.49 
 
 
699 aa  342  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.13 
 
 
676 aa  340  4e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  33.76 
 
 
718 aa  340  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  32.51 
 
 
716 aa  336  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0042  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.59 
 
 
738 aa  336  7e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0874  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  31.57 
 
 
989 aa  333  4e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  normal  0.996162 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0501  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.46 
 
 
724 aa  333  5e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.17587  normal  0.555543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.04 
 
 
717 aa  332  9e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.82 
 
 
712 aa  330  6e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  32.64 
 
 
1033 aa  330  7e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  33.96 
 
 
683 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5262  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.89 
 
 
737 aa  325  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.29 
 
 
721 aa  326  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  31.81 
 
 
727 aa  326  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  31.12 
 
 
688 aa  323  6e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  33.03 
 
 
654 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  34.02 
 
 
692 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.18 
 
 
762 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.34 
 
 
758 aa  320  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  33.43 
 
 
703 aa  320  6e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  32.81 
 
 
882 aa  319  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.22 
 
 
774 aa  317  4e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  31.58 
 
 
1388 aa  315  9.999999999999999e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.63 
 
 
748 aa  314  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.96 
 
 
737 aa  313  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  39.82 
 
 
762 aa  306  6e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.53 
 
 
722 aa  306  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1708  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.33 
 
 
641 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0465  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.48 
 
 
1131 aa  295  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0754  hypothetical protein  30.92 
 
 
643 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.39993 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0739  hypothetical protein  30.29 
 
 
639 aa  260  7e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.778114  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4781  4Fe-4S ferredoxin  37.3 
 
 
654 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2723  hypothetical protein  31.67 
 
 
641 aa  253  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>