25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1008 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1008  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4266  hypothetical protein  47.79 
 
 
235 aa  205  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0284  hypothetical protein  42.26 
 
 
246 aa  193  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4617  hypothetical protein  39.09 
 
 
247 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179085 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0954  hypothetical protein  43.24 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.636597  unclonable  0.0000321673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4587  hypothetical protein  43.06 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0999  OmpA/MotB domain-containing protein  36.51 
 
 
255 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0007  hypothetical protein  26.63 
 
 
248 aa  55.5  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3877  OmpA/MotB domain protein  29.41 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0517  chemotaxis protein MotB, putative  27.72 
 
 
334 aa  53.1  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3412  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like protein  26.11 
 
 
220 aa  52.4  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6677  hypothetical protein  25.77 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000431405  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6041  flagellar motor protein  32.81 
 
 
254 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0627  chemotaxis protein MotB, putative  28.93 
 
 
317 aa  48.5  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0702  chemotaxis protein MotB, putative  28.93 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.66676  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0111  putative chemotaxis protein MotB  31.13 
 
 
366 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.876361  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2072  putative chemotaxis protein MotB  28.45 
 
 
363 aa  47  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.291136  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2266  hypothetical protein  27.47 
 
 
212 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1070  chemotaxis protein MotB, putative  28.1 
 
 
317 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.98925  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3786  chemotaxis protein MotB-related protein  22.18 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3622  peptidoglycan-associated lipoprotein  23.64 
 
 
177 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.595111  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0911  chemotaxis protein MotB, putative  27.69 
 
 
316 aa  43.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0745423  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1218  putative chemotaxis protein MotB  26.78 
 
 
337 aa  43.1  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2103  hypothetical protein  29.89 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2674  OmpA/MotB  30 
 
 
169 aa  42  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>