More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0988 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0988  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 388 aa  774    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  98.71 
 
 		 388 aa  766    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  76.55 
 
 		 388 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  75.26 
 
 		 387 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  73.97 
 
 		 387 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1986  hypothetical protein  69.33 
 
 		 388 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  60.47 
 
 		 388 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  58.66 
 
 		 388 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  58.14 
 
 		 388 aa  460  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3709  hypothetical protein  60.21 
 
 		 388 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392463  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0628  protein of unknown function DUF214  62.44 
 
 		 391 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0398137 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  59.69 
 
 		 388 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  58.4 
 
 		 388 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  58.66 
 
 		 388 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  58.66 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  58.66 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  59.84 
 
 		 389 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  57.88 
 
 		 388 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  58.14 
 
 		 388 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  38.03 
 
 		 394 aa  265  8.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1512  hypothetical protein  34.28 
 
 		 396 aa  212  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0251  protein of unknown function DUF214  35.77 
 
 		 440 aa  210  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  33.25 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  34.03 
 
 		 396 aa  206  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03340  ABC transporter permease  33.14 
 
 		 431 aa  193  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2023  hypothetical protein  30.97 
 
 		 395 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  31.65 
 
 		 400 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2258  protein of unknown function DUF214  32.56 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3164  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  29.53 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  29.69 
 
 		 488 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  24.26 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  24.26 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  29 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  26.4 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  25.12 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  27.85 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.75 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  23.28 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  25.91 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  28.9 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  23.97 
 
 		 414 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  25.61 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  24.13 
 
 		 652 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  21.79 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  26.51 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  23.91 
 
 		 842 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  23.17 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  28.84 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  28.63 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  24.47 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0954  hypothetical protein  24.88 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  26 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  25.28 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  23.91 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  26.58 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.32 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.27 
 
 		 656 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  25.1 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  31.91 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  25.87 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  29.89 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.68 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  27.34 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  23.36 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  25 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  24.3 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  24.47 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  25.91 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  27.97 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  26.29 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  27.05 
 
 		 403 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  25.08 
 
 		 405 aa  67  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.05 
 
 		 397 aa  67  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  23.79 
 
 		 656 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  27.78 
 
 		 650 aa  67  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  23.55 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  28.92 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  23.36 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  26.38 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.45 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  26.22 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  27.39 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  25.1 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  26.22 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  28.26 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  29.88 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  28.52 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  27.13 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  25.34 
 
 		 640 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  30.05 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  23.93 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  26.78 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  23.75 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1472  ABC transporter permease protein  25.48 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  26.82 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3335  ABC transporter, permease protein  21.88 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.887003  normal  0.0261397 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  23.66 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  24.01 
 
 		 647 aa  64.3  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  22.09 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>