More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0961 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  79.35 
 
 
398 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  100 
 
 
397 aa  815    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  96.98 
 
 
397 aa  794    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  77.08 
 
 
397 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  75.95 
 
 
397 aa  629  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  74.18 
 
 
396 aa  615  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  75.44 
 
 
398 aa  617  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  64.39 
 
 
396 aa  548  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  63.89 
 
 
397 aa  531  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  62.53 
 
 
395 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  52.79 
 
 
397 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  52.56 
 
 
393 aa  430  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  52.82 
 
 
393 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  51.89 
 
 
395 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  50.38 
 
 
396 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  44.16 
 
 
395 aa  360  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  44.36 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  45.5 
 
 
397 aa  354  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  43.81 
 
 
398 aa  354  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  44.56 
 
 
461 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  43.83 
 
 
393 aa  345  7e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  44.62 
 
 
394 aa  338  7e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  40.66 
 
 
398 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  44.39 
 
 
398 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  44.13 
 
 
398 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  41.95 
 
 
395 aa  308  8e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  43.95 
 
 
400 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  38.89 
 
 
394 aa  287  2e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  40.31 
 
 
393 aa  280  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  35.97 
 
 
396 aa  270  4e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  36.8 
 
 
393 aa  268  1e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  36.53 
 
 
393 aa  268  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  36.02 
 
 
405 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  34.34 
 
 
404 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  34.05 
 
 
397 aa  203  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  32.31 
 
 
403 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  31.35 
 
 
389 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  34.32 
 
 
389 aa  178  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  31.23 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  31.23 
 
 
389 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  31.62 
 
 
385 aa  169  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  32.32 
 
 
407 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  33.24 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  30 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  31.06 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  31.53 
 
 
402 aa  163  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  32.19 
 
 
404 aa  163  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  29.66 
 
 
375 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  31.35 
 
 
396 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  31.57 
 
 
389 aa  160  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  30.18 
 
 
375 aa  160  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  30.47 
 
 
392 aa  160  4e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  30.47 
 
 
375 aa  159  5e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  30.91 
 
 
390 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  29.6 
 
 
395 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  30.56 
 
 
395 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  30.56 
 
 
395 aa  159  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  30.56 
 
 
395 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  30.56 
 
 
395 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  30.56 
 
 
395 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  29.6 
 
 
395 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  31.46 
 
 
396 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  30.47 
 
 
395 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  30.47 
 
 
395 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  31.19 
 
 
396 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  33.88 
 
 
396 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  30.93 
 
 
396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  31.44 
 
 
396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  30.56 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  31.44 
 
 
396 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  28.72 
 
 
389 aa  156  7e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  31.44 
 
 
396 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  31.44 
 
 
396 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  31.44 
 
 
396 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  31.44 
 
 
396 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  31.44 
 
 
396 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  30 
 
 
395 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  31.02 
 
 
392 aa  155  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1506  aminotransferase, class I and II  30.96 
 
 
368 aa  155  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  32.3 
 
 
403 aa  153  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  32.09 
 
 
395 aa  153  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  31.12 
 
 
387 aa  153  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  29.27 
 
 
387 aa  153  5e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  30.75 
 
 
392 aa  153  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  31.66 
 
 
412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  28.72 
 
 
389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  30.56 
 
 
379 aa  152  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  29.84 
 
 
400 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  31.45 
 
 
397 aa  152  8.999999999999999e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  31.35 
 
 
400 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  30.93 
 
 
396 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  30.03 
 
 
387 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  31.51 
 
 
383 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  32.25 
 
 
396 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  30.19 
 
 
389 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  31.77 
 
 
390 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  30.49 
 
 
383 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  29.32 
 
 
400 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  30.63 
 
 
390 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>