88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0920 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0920  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.81019e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3326  hypothetical protein  91.84 
 
 
245 aa  424  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.884762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0852  hypothetical protein  54.92 
 
 
247 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  35.74 
 
 
268 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6547  alpha/beta hydrolase BEM46  34.81 
 
 
268 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  38.46 
 
 
276 aa  98.2  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3465  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2272  hypothetical protein  28.68 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  31.6 
 
 
278 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  29.75 
 
 
271 aa  85.5  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  36.22 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  32.8 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  36.16 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  28 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  35.03 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  27.52 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  26.36 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  32.04 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  32.92 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  34.27 
 
 
275 aa  72  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0482  hydrolase of the alpha/beta superfamily  33.52 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0662813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  31.17 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0358  hypothetical protein  34.25 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233875  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  31.58 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  29.22 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  31.82 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4295  hypothetical protein  34.16 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0269643  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  26.52 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  34.66 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  32.03 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  26.02 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  28.57 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2105  hypothetical protein  28.89 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290661  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_6846  predicted protein  29.56 
 
 
207 aa  63.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175965  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  29.06 
 
 
307 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3977  hypothetical protein  27.85 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  29.06 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  30.2 
 
 
324 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  29.61 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  26.32 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3993  hypothetical protein  27.4 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0129209  normal  0.0990612 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3674  hypothetical protein  26.29 
 
 
296 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0158425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  29.41 
 
 
274 aa  58.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  30.81 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  25.26 
 
 
290 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4186  putative alpha/beta superfamily hydrolase  31.94 
 
 
289 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0367374  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  24.42 
 
 
295 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  26.46 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  29.8 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  29.8 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  29.8 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  30.17 
 
 
274 aa  52.8  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7576  predicted protein  25.95 
 
 
162 aa  52  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.30482 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  26.18 
 
 
292 aa  52  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3184  hypothetical protein  34.13 
 
 
300 aa  52  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  29.11 
 
 
285 aa  52  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  27.42 
 
 
306 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  27.87 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  29.01 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  26.98 
 
 
285 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  28.87 
 
 
297 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1061  temperature sensitive supressor-like protein  27.01 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.133168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  28.42 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1334  hydrolase with alpha/beta fold  23.58 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.706412  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
421 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  24.68 
 
 
287 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  27.52 
 
 
336 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  28.86 
 
 
286 aa  46.2  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.72 
 
 
294 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  30.23 
 
 
331 aa  45.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  25.96 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  32 
 
 
295 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2250  hypothetical protein  31.85 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0744854  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  28.96 
 
 
294 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  28.28 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  28.67 
 
 
267 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.1 
 
 
297 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2845  temperature sensitive supressor-like  25.91 
 
 
267 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02210  conserved hypothetical protein  24.59 
 
 
358 aa  42.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5113  predicted protein  33.91 
 
 
276 aa  42.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00868611  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  28.32 
 
 
296 aa  42.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
302 aa  42  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  26.37 
 
 
303 aa  42  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  36.45 
 
 
345 aa  42  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>