More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0911 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  81.79 
 
 		 368 aa  649    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  81.47 
 
 		 368 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  99.18 
 
 		 368 aa  765    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 368 aa  771    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  82.07 
 
 		 368 aa  646    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  77.99 
 
 		 373 aa  620  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  77.05 
 
 		 380 aa  616  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.22 
 
 		 369 aa  577  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.02 
 
 		 369 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.22 
 
 		 375 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.03 
 
 		 370 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.79 
 
 		 373 aa  438  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.77 
 
 		 372 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.04 
 
 		 379 aa  428  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.95 
 
 		 374 aa  428  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.85 
 
 		 371 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.57 
 
 		 380 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.57 
 
 		 370 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.57 
 
 		 380 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.3 
 
 		 379 aa  421  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.31 
 
 		 372 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.15 
 
 		 367 aa  420  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.57 
 
 		 373 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.31 
 
 		 372 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.29 
 
 		 373 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.46 
 
 		 379 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.66 
 
 		 357 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.46 
 
 		 379 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.75 
 
 		 379 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.2 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.2 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.2 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.2 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.2 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 379 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.2 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 379 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.2 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.88 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.77 
 
 		 372 aa  408  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.37 
 
 		 379 aa  404  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 		 380 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.63 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.65 
 
 		 380 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.25 
 
 		 370 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 370 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 		 373 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 		 380 aa  402  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.39 
 
 		 387 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.62 
 
 		 387 aa  398  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.46 
 
 		 372 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.12 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.74 
 
 		 379 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.37 
 
 		 369 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.34 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.34 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.34 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.98 
 
 		 381 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  52.34 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.34 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.34 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.81 
 
 		 381 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.34 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.34 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.34 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.41 
 
 		 394 aa  394  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.22 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.51 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.52 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.52 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.21 
 
 		 369 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.52 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  51.52 
 
 		 382 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.52 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 		 379 aa  388  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.52 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.97 
 
 		 381 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.52 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.26 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  50.97 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.38 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3113  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 		 374 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.52 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.87 
 
 		 376 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.16 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 		 375 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 367 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 		 378 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.59 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.86 
 
 		 376 aa  386  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.77 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 376 aa  387  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.69 
 
 		 374 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.78 
 
 		 391 aa  383  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.24 
 
 		 374 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>