100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0875 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  60.26 
 
 		 895 aa  1052    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  100 
 
 		 893 aa  1833    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  42.15 
 
 		 782 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  37.88 
 
 		 936 aa  529  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  34.13 
 
 		 885 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  32.86 
 
 		 945 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  40.43 
 
 		 809 aa  326  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  27.81 
 
 		 826 aa  183  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  26.64 
 
 		 731 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  26.13 
 
 		 820 aa  148  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  27.13 
 
 		 762 aa  124  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  24.02 
 
 		 742 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  23.99 
 
 		 742 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  23.79 
 
 		 742 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  22.98 
 
 		 639 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  23.23 
 
 		 646 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  23.25 
 
 		 639 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  28.51 
 
 		 898 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  22.97 
 
 		 639 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  28.18 
 
 		 898 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  22.16 
 
 		 639 aa  107  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  22.71 
 
 		 639 aa  106  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  22.49 
 
 		 640 aa  106  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  27.89 
 
 		 898 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  27.17 
 
 		 650 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  27.31 
 
 		 650 aa  104  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  27.09 
 
 		 650 aa  102  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  22.49 
 
 		 639 aa  101  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  26.52 
 
 		 650 aa  101  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  26.86 
 
 		 650 aa  101  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  26.53 
 
 		 650 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  23.82 
 
 		 741 aa  95.5  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  22.02 
 
 		 789 aa  94.7  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  23.32 
 
 		 656 aa  93.6  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  24.07 
 
 		 729 aa  94  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  21.62 
 
 		 778 aa  92.8  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  25.21 
 
 		 639 aa  92  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  23.7 
 
 		 663 aa  92.4  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  24.44 
 
 		 762 aa  91.7  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  22.93 
 
 		 764 aa  90.1  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  25.77 
 
 		 745 aa  88.2  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  22.87 
 
 		 766 aa  87.8  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  21.56 
 
 		 789 aa  87.8  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  22.05 
 
 		 788 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  21.92 
 
 		 816 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  24.79 
 
 		 639 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  22.54 
 
 		 761 aa  84  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  24.79 
 
 		 639 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  22.65 
 
 		 764 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  22.65 
 
 		 764 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  22.86 
 
 		 761 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  28.39 
 
 		 762 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  25.34 
 
 		 716 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  24.51 
 
 		 719 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  21.71 
 
 		 788 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  27.61 
 
 		 765 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  28.39 
 
 		 762 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  27.24 
 
 		 758 aa  77  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  23.74 
 
 		 822 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  28.09 
 
 		 720 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  27.46 
 
 		 653 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  24.86 
 
 		 724 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  26.25 
 
 		 770 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  23.76 
 
 		 722 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  23.31 
 
 		 833 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  23.61 
 
 		 856 aa  69.3  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  23.35 
 
 		 755 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  23.18 
 
 		 639 aa  66.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3279  hypothetical protein  22.59 
 
 		 854 aa  64.7  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  24.31 
 
 		 785 aa  64.7  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  23.93 
 
 		 667 aa  63.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  21.86 
 
 		 671 aa  63.9  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  22.83 
 
 		 655 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  24.79 
 
 		 725 aa  62.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  25.67 
 
 		 738 aa  62.4  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  24.24 
 
 		 727 aa  60.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  24.59 
 
 		 660 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2907  hypothetical protein  22 
 
 		 793 aa  58.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  21.64 
 
 		 857 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1111 aa  57.4  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  24.43 
 
 		 735 aa  56.2  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  23.73 
 
 		 843 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  26.42 
 
 		 656 aa  55.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  22.61 
 
 		 741 aa  54.7  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  24.55 
 
 		 731 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  34.72 
 
 		 671 aa  52.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0438  hypothetical protein  23.31 
 
 		 791 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.398757  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  24.55 
 
 		 731 aa  52.4  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  24.55 
 
 		 724 aa  51.2  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0437  hypothetical protein  22.68 
 
 		 791 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  23.93 
 
 		 745 aa  50.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  21.71 
 
 		 729 aa  50.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  24.04 
 
 		 730 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  21.28 
 
 		 764 aa  48.9  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4161  hypothetical protein  23.5 
 
 		 785 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0782432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  24.04 
 
 		 730 aa  48.1  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  28.48 
 
 		 730 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  24.36 
 
 		 714 aa  46.2  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000872  cytochrome c-type protein TorY  24.18 
 
 		 364 aa  44.7  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  22.52 
 
 		 696 aa  44.7  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>