More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0870 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0870  glycerol kinase  100 
 
 		 495 aa  994    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.758789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3376  glycerol kinase  93.94 
 
 		 495 aa  931    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  60.24 
 
 		 496 aa  620  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  57.61 
 
 		 520 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  56.85 
 
 		 496 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  56.85 
 
 		 496 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  58.18 
 
 		 505 aa  595  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  58.59 
 
 		 507 aa  592  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  55.94 
 
 		 496 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  55.24 
 
 		 505 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  58.7 
 
 		 496 aa  580  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  55.21 
 
 		 496 aa  578  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  55.65 
 
 		 500 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  55.65 
 
 		 500 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  55.65 
 
 		 500 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  55.24 
 
 		 500 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  55.21 
 
 		 496 aa  579  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  55.44 
 
 		 500 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  55.65 
 
 		 500 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  54.81 
 
 		 496 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  55.01 
 
 		 496 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  55.01 
 
 		 496 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  54.81 
 
 		 496 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  55.01 
 
 		 496 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  55.01 
 
 		 496 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  55.21 
 
 		 496 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  56.59 
 
 		 502 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  56.45 
 
 		 505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  54.93 
 
 		 503 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  54.56 
 
 		 499 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  54.84 
 
 		 500 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  56.85 
 
 		 496 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  53.83 
 
 		 497 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  54.64 
 
 		 518 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  52.94 
 
 		 497 aa  566  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  54.66 
 
 		 513 aa  567  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  54.64 
 
 		 518 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  54.64 
 
 		 518 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  54.64 
 
 		 518 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  54.64 
 
 		 518 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  54.64 
 
 		 503 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  55.47 
 
 		 496 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  53.35 
 
 		 498 aa  563  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  55.56 
 
 		 496 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  54.64 
 
 		 503 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  56.71 
 
 		 501 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  56.65 
 
 		 496 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  53.75 
 
 		 499 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2862  glycerol kinase  53.04 
 
 		 499 aa  560  1e-158  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  54.64 
 
 		 501 aa  560  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  53.85 
 
 		 501 aa  558  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  52.81 
 
 		 501 aa  559  1e-158  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  55.12 
 
 		 496 aa  555  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  51.81 
 
 		 498 aa  552  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  53.14 
 
 		 499 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  56.65 
 
 		 499 aa  551  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  54.55 
 
 		 499 aa  551  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  54.97 
 
 		 497 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  54.64 
 
 		 510 aa  551  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  53.07 
 
 		 498 aa  549  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  53.07 
 
 		 498 aa  549  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  52.76 
 
 		 499 aa  546  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  52.54 
 
 		 489 aa  548  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  55.81 
 
 		 498 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  52.82 
 
 		 501 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  54.03 
 
 		 498 aa  543  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  49.7 
 
 		 501 aa  541  1e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  53.32 
 
 		 509 aa  542  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  52.64 
 
 		 495 aa  542  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  53.32 
 
 		 503 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  52.52 
 
 		 507 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  52.82 
 
 		 501 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  53.75 
 
 		 497 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  55.6 
 
 		 498 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  56.34 
 
 		 497 aa  541  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  52.52 
 
 		 507 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  52.32 
 
 		 510 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  52.77 
 
 		 493 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  53.32 
 
 		 503 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  52.52 
 
 		 507 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0041  glycerol kinase  50.8 
 
 		 499 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.684813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  54.88 
 
 		 498 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  51.51 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  51.51 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  52.62 
 
 		 499 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  52.36 
 
 		 494 aa  535  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  52.52 
 
 		 503 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  51.31 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  52.02 
 
 		 516 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  51.82 
 
 		 494 aa  535  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  51.31 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  53.44 
 
 		 498 aa  536  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  51.31 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  52.62 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  51.51 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  52.42 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  52.77 
 
 		 494 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  51.51 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  51.31 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  51.31 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>