More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0856 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
268 aa  548  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  92.91 
 
 
268 aa  518  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.40796e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  57.09 
 
 
278 aa  328  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  56.82 
 
 
264 aa  321  7e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  40.98 
 
 
365 aa  183  2e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  3.43868e-06  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  40.51 
 
 
392 aa  178  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  36.17 
 
 
280 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  33.73 
 
 
479 aa  147  2e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  39.63 
 
 
289 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  34.72 
 
 
484 aa  145  7e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  33.07 
 
 
478 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  35.78 
 
 
285 aa  143  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 
521 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  34.13 
 
 
549 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  33.81 
 
 
266 aa  141  1e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  7.04965e-06  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  36.79 
 
 
632 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  33.47 
 
 
605 aa  139  4e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  34.98 
 
 
436 aa  139  5e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.76404e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  33.89 
 
 
479 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  33.71 
 
 
445 aa  138  8e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  35.77 
 
 
282 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  35.6 
 
 
284 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  32.22 
 
 
351 aa  136  3e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  35.24 
 
 
514 aa  136  3e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  36.32 
 
 
632 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  32.9 
 
 
474 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  39.63 
 
 
289 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  37.97 
 
 
289 aa  135  6e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  33.98 
 
 
494 aa  134  1e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  35.68 
 
 
278 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  34.17 
 
 
487 aa  132  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  31.13 
 
 
541 aa  132  8e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  36.87 
 
 
279 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  36.87 
 
 
279 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  37.67 
 
 
500 aa  131  1e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  31.16 
 
 
265 aa  131  1e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  32.22 
 
 
489 aa  130  2e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  34.84 
 
 
489 aa  130  2e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  33.86 
 
 
573 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  34.6 
 
 
248 aa  130  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  6.17052e-06  hitchhiker  6.5256e-06 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  34.68 
 
 
423 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 
470 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.90245e-07  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 
604 aa  128  8e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  36.59 
 
 
489 aa  128  8e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  33.86 
 
 
561 aa  128  9e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  34.78 
 
 
489 aa  128  1e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  33.77 
 
 
548 aa  128  1e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  29.48 
 
 
481 aa  127  2e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  33.21 
 
 
262 aa  127  2e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  33.91 
 
 
502 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  32 
 
 
513 aa  126  4e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  35.42 
 
 
266 aa  126  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  4.70092e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  33.06 
 
 
479 aa  126  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  35.04 
 
 
569 aa  125  8e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  35.71 
 
 
528 aa  125  8e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  35.04 
 
 
567 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  33.47 
 
 
485 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  34.78 
 
 
266 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  32.27 
 
 
489 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  34.55 
 
 
533 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  33.07 
 
 
489 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  33.07 
 
 
489 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  1.08832e-09 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  33.07 
 
 
489 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  33.47 
 
 
489 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
483 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  33.47 
 
 
489 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  33.47 
 
 
489 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  33.47 
 
 
489 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  33.07 
 
 
489 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  29.75 
 
 
484 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  33.47 
 
 
490 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  32.68 
 
 
269 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  31.14 
 
 
424 aa  123  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  32.68 
 
 
269 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  31.78 
 
 
490 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  35.18 
 
 
474 aa  122  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  33.78 
 
 
259 aa  122  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  33.46 
 
 
268 aa  122  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  30.83 
 
 
262 aa  122  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  35.35 
 
 
275 aa  122  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  30.36 
 
 
487 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  30.36 
 
 
487 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  31.01 
 
 
268 aa  122  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  30.2 
 
 
562 aa  121  1e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  30.36 
 
 
487 aa  121  1e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  30.36 
 
 
487 aa  121  1e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  28.31 
 
 
554 aa  121  1e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  30.36 
 
 
487 aa  121  1e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  31.39 
 
 
481 aa  121  1e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  30.74 
 
 
475 aa  120  2e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  32.48 
 
 
473 aa  120  2e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  31.91 
 
 
269 aa  120  2e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  33.74 
 
 
427 aa  119  4e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
486 aa  119  4e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  34.11 
 
 
263 aa  119  4e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  34.09 
 
 
553 aa  119  5e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  29.27 
 
 
487 aa  119  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  34.21 
 
 
486 aa  119  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  30.26 
 
 
480 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  28.81 
 
 
487 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>