More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0850 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  97.91 
 
 		 480 aa  969    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 492 aa  1015    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  58.55 
 
 		 478 aa  579  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 475 aa  497  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 479 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 532 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  45.82 
 
 		 479 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 477 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  45.82 
 
 		 479 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.66 
 
 		 477 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 472 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 472 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  46.58 
 
 		 475 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  45.28 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  44.28 
 
 		 475 aa  422  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 475 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  45.06 
 
 		 478 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  46.37 
 
 		 474 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 472 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 472 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  44.99 
 
 		 483 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  46.37 
 
 		 474 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  45.06 
 
 		 473 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.61 
 
 		 475 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  45.3 
 
 		 493 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 487 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 474 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 473 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 474 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  42.95 
 
 		 500 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 474 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 475 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 471 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  45.06 
 
 		 473 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  46.37 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 472 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 530 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 474 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 509 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 473 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  45.94 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  46.9 
 
 		 480 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  45.94 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  47.32 
 
 		 480 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  46.47 
 
 		 479 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.55 
 
 		 487 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  46.25 
 
 		 479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  46.47 
 
 		 479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  44.42 
 
 		 482 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  43.9 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 473 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 483 aa  403  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 470 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  41.59 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 470 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.41 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 477 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.71 
 
 		 484 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 489 aa  391  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 502 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.81 
 
 		 486 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 491 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 477 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  40.95 
 
 		 469 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  41.03 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 469 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.33 
 
 		 475 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  39.91 
 
 		 472 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0157  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 477 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00565529  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.58 
 
 		 483 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  41.47 
 
 		 473 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 469 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.68 
 
 		 483 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  41.45 
 
 		 481 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0076  transcriptional regulator  43.47 
 
 		 488 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.43 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.25 
 
 		 479 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  40.76 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1471  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.83 
 
 		 472 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.0159158 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 473 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3105  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.6 
 
 		 486 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 482 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.39 
 
 		 473 aa  368  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.81 
 
 		 498 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>