More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0802 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 71 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1419  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 432 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0683  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  43.21 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  43.21 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  40.68 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  45 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 1143 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3034  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123448  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 187 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  38.37 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 193 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  43.33 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  32.65 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  38.89 
 
 		 245 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3859  hypothetical protein  38.46 
 
 		 233 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0734  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  47.62 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  42.62 
 
 		 347 aa  50.8  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  37.21 
 
 		 190 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0995  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.651052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 230 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 433 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  37.21 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 197 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  34.34 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 211 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0453  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  41.94 
 
 		 370 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1374  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.717323 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 263 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3681  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  34.34 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  39.68 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  39.66 
 
 		 270 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 288 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  31.75 
 
 		 101 aa  48.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  38.37 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  36.05 
 
 		 285 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2246  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  42.86 
 
 		 285 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  42.86 
 
 		 285 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 209 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  42.86 
 
 		 285 aa  47.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>