More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0786 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0786  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 166 aa  341  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2277  DNA repair protein RadC  78.92 
 
 		 166 aa  284  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1463  DNA repair protein RadC  69.7 
 
 		 167 aa  243  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.794646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2168  DNA repair protein RadC  56.96 
 
 		 163 aa  190  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00702134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0216  DNA repair protein RadC  56.96 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0275  DNA repair protein RadC  56.69 
 
 		 163 aa  183  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00125645  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3737  DNA repair protein RadC  55.63 
 
 		 168 aa  180  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1885  DNA repair protein RadC  53.89 
 
 		 166 aa  173  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0803  DNA repair protein, RadC-like  56.08 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  64.23 
 
 		 229 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  64.23 
 
 		 228 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  61.72 
 
 		 229 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  60.8 
 
 		 231 aa  150  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  60.16 
 
 		 230 aa  150  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  60.8 
 
 		 231 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  60.42 
 
 		 236 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  48.99 
 
 		 233 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  52.34 
 
 		 227 aa  134  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  58.25 
 
 		 230 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  52.14 
 
 		 231 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  54.63 
 
 		 227 aa  130  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  55.14 
 
 		 227 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  55.56 
 
 		 235 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  43.05 
 
 		 229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  50.85 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  52.54 
 
 		 241 aa  127  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  51.69 
 
 		 226 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  54.21 
 
 		 206 aa  127  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  45.21 
 
 		 228 aa  127  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  44.52 
 
 		 228 aa  127  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  50.85 
 
 		 226 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  55.65 
 
 		 229 aa  127  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 225 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  49.21 
 
 		 229 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 225 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 225 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 225 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 225 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 225 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 225 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 225 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  50.85 
 
 		 227 aa  124  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3111  DNA repair protein RadC  52.29 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111017  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  49.15 
 
 		 227 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  43.15 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  42.76 
 
 		 228 aa  121  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  48.31 
 
 		 227 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  47.15 
 
 		 233 aa  120  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  42.38 
 
 		 229 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  50.85 
 
 		 232 aa  119  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  47.66 
 
 		 228 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  52.38 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  40.38 
 
 		 227 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  41.61 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  46.34 
 
 		 223 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3004  DNA repair protein RadC  48.18 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00190795  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 222 aa  111  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  42.61 
 
 		 225 aa  111  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  50.96 
 
 		 223 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2374  DNA repair protein RadC  40.14 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  49.47 
 
 		 232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0244  DNA repair protein  49.02 
 
 		 151 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  37.18 
 
 		 222 aa  107  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  41.78 
 
 		 223 aa  107  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  50.93 
 
 		 224 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  39.5 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  46.55 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  47.31 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  42.38 
 
 		 224 aa  104  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  49.09 
 
 		 224 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0302  DNA repair protein RadC  39.84 
 
 		 225 aa  103  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  45.37 
 
 		 223 aa  103  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0110  hypothetical protein  41.32 
 
 		 247 aa  103  9e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.222701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  35.62 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3048  DNA repair protein RadC  39.84 
 
 		 221 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000891178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 233 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  46.73 
 
 		 223 aa  101  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3561  DNA repair protein RadC  41.59 
 
 		 147 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0170  DNA repair protein RadC  42.59 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1619  DNA repair protein RadC  47.27 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  38.52 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 246 aa  99.8  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  43.64 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1383  putative DNA repair protein RadC  36.77 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  45.37 
 
 		 234 aa  99.4  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  49.07 
 
 		 224 aa  99.4  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  48.62 
 
 		 245 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2916  DNA repair protein RadC  39.67 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  49.51 
 
 		 257 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  42.59 
 
 		 222 aa  99  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  49.51 
 
 		 257 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  38.52 
 
 		 215 aa  99.4  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  49.51 
 
 		 257 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  47.71 
 
 		 224 aa  99  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  43.69 
 
 		 222 aa  99  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0750  RadC family DNA repair protein  37.04 
 
 		 162 aa  98.6  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  45.71 
 
 		 249 aa  97.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0973  DNA repair protein RadC  48.04 
 
 		 225 aa  97.8  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0497584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2951  DNA repair protein, RadC family protein  44.63 
 
 		 158 aa  97.8  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2092  DNA repair protein RadC  45.92 
 
 		 223 aa  97.4  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>